mtDNA range    mtlen     Chr. Coordinates Build 37.3    chrlen    Blast score   HSA number      HSA Coordinates

  1274-1344        71     ChrY: 4272822..4272892            71        100%
 14275-16018  }  1744     ChrY: 8291603..8293329          1727         70%
 16087-16123  }    37     ChrY: 8293406..8293441            36         89%
 16297-16564  }   268     ChrY: 8293617..8293886           270         69%
   598-1177   }   570     ChrY: 8294669..8295240           572         77%
  1161-3459   }  2299     ChrY: 8297560..8299854          2295         74%
  4058-4960   }   903     ChrY: 8299879..8300755           877         71%
   
  9387-10303      917     ChrY:11747774..11748729          956         74%
  5614-6983      1370     ChrY:11748742..11750087         1346         74%

.................

'ChrY:4272822..4272892'Back
mtDNA 1274-1344

gggctacaccttgacctaacgtctttacgtgggtacttgcgcttactttgtagccttcat
cagggtttgct

.................

'ChrY:8291603..8293329'Back
mtDNA 14275-16018

tRNA-glu       NT_011896.9|HsY_12053  chromosome  Y  5582481-5582548  (8292001-8292068)
               T ATTCTCA CATGG ACTATAA CTATG ACTA  ATGAT ATGAAA. ACCAT C GTTG TACTT CAAC TA TAAGAAC
tRNA-thr       NT_011896.9|HsY_12053  chromosome  Y  5583679-5583745  (8293199-8293265)
               TCTCTTG TA GTAT AATTCA  ATAC T CTGAT CTTCTAA ACCAG AAAT GGAGA ATCC    CCTCT  ACAGGAC A
tRNA-pro       NT_011896.9|HsY_12053  chromosome  Y  5583748-5583815  (8293268-8293335)
               T CAAGAAA AAAGC ATTTCT  ACTTC ACCG TCAAC TCCCAAA GCTGA A ATTC TA.ATT  AAAT TA .TCCCTG

glu
thr
pro

ACCCCAACCTCTCACCCTCAATAATTATCTTTCTATGCTATTAAAATTAATTGTGACCACCACCCCATCA
TACTCAAATATTCATTGGACCAATGCCAACTCTCTTAATAATTCTAATAATAAAGACCCTCAAATATCAG
TAGTTGACCCTCATGTTTCAGGATATTCCTTAATAGTGATAGCCACAGTATAACCAAAAACAACCATCAT
ATCACCTAAATAAATAAAAAAAAGACTATTGACCCTATGAAACCCCCAAGAAAATTCAACACAATTCCAC
AACACACAGCATCACTAATAATTAACTCTAGGCCTCCATAAATAGAAGAAAGTTTTGAAGAAAAACCTAC
AAACCTTACAGCCAAGGGAATACTTAATAAAAATAAAGCATATTACATTATTCTCACATGGACTATAACT
ATGACTAATGATATGAAAACCATCGTTGTACTTCAACTATAAGAACATTAATGACCAATACTCACAAAAC
ACATTGCTAATAAAATTATTAACTACTAATTCATTGATCTTTCCACACCATCTAACATTTCTACATGATG
AAACTTTGGATCACTTCTTGGTGGCTGCCTAATTCTCCAGATCCTCACAGGATTATTCTTGGCCCTGCAC
TATACTTCAGACACCTCAACTGCATTTCCTTCAGTTGCTCATATCAGCCAAGATGTAAACTGCAGTTGAA
TGGTTTGTTATTTTCAGGACAATGGCCCTTCAATATTTTTCATCTGCTTCTTCTTATGTGTTGACCAAGG
CTTATATTACAAATCATTTCTATTCCTGGAAACCTGAAATATTGGCATTATCCTCCTATTCACAACTATA
GCATCAGCATTCATAGGCTACATGCTCCCATGGGACAAATATCATTTTGAGGCACTACAGTAATTACAAA
TCTGCTATCAGCCATACAATATATTGGAACTGACCTGGTACAATGAATCTGAGGCAGATTCTCAGTGAAC
AAGGCCACCCTCAAACAACTATTCAGATTCAATTTCATCTTACTTTTCAACCCTACAGCTCTAGCAACGA
TTCACCTTTTATTCTTGCATGAGAGAGGATTTTTAGGAGTTTCATCAGACCCAGACAAAATCATGCTCCA
CCCCTACTATAAAACCAAAGATATCTAGGTTTAATTTTTCTTCTCCTTCTAATAACTCTAGTACTGTTTT
CACCAGACCTCCTTAACAACCCAGATAATTAGAGTTTAGCCAACCCCCTCAATACTCCACCCCACATTAA
CCAATACCTTTTTTTGGTGTACCCAATCTTACTACCTATCCCTAACAACCTAGGAAGTGTACTGGCCCTC
ATATCATCCACTCTCATTCTAGCAGTTAAGCAGTTATTTCTGTACTTCACAAGTCTAAGCAACAAGGCAT
CATATGCCAGCCATTAAATCAATGCATATTCTGAATCCTAGTGGCTGTTCTGTTTACATTCACATGAATC
GGAGGGAAGCCATCAAATACCCTTTTATTGACATCAGACAGACAGCATCTATCATGTACTTCTCTACCAT
CCTCACCCTTATGCTGCTCACTACCCTAATTGAAAATAAATTATTTAAATGAAAATTCTCTTGTAGTATA
ATTCAATACTCTGATCTTCTAAACCAGAAATGGAGAATCCCCTCTACAGGACAACTCAAGAAAAAAGCAT
TTCTACTTCACCGTCAACTCCCAAAGCTGAAATTCTAATTAAATTAT

...............

'ChrY:8293406..8293441'Back
mtDNA 16087-16123

TATGTATTTTGTACATTACTGCTATCC.CCATGAATA

...............

'ChrY:8293617..8293886'Back
mtDNA 16297-16564
CCTTAATATGACATAGTGCCTACATTTATTTTTCAGACATAACACATTTCTGTCAAGAAATCTCTTGTCA
ACATGGATATCCTCTACCAAATCCTGATCTCTTAATCTACCAACTTCTGTGAAATCACCATCCTAATTGG
GAGTACTACCCACCTCATTCTGGGCCCTTAACACATGTGGCTGACTATTTTGAAAGTATAACTGGCAACT
GGTTCTTACTTCAGGACCATGAAACTAAGATCACTCACATGTTCCCCTTAAATAAGACAT

................

'ChrY:8294669..8295240'>Back
mtDNA 598-1177

tRNA-phe       NT_011896.9|HsY_12053  chromosome  Y  5585136-5585200  (8294656-8294720)
               GTTAACA TA GCTT TATTATTTCA   AAGC A AGACA CTGAAAA TGTCT AGAT GGGTC TAGAC AATCC CATAAAC A

phe

TCAAAGCAAGACACTGAAAATGTCTAGATGGGTCTAGACAATCCCATAAACAAACAGATTTAGTCCAGGC
CTTTCTATTAGATCCTAGTAAGATTACACAAGCAAGCATCCCTGAGCCGGTGAAAATGCCTTATAGATCA
CCCGGATCAAAAGGAGTAAGAATCAAGGATGCACAAATGCAGCTCAAAACACTTTGCTCAATCACAACCC
TGTGGGAAACAGCAGTGATAAATATTTAGTAATAAATGAATATTTAACTAAGCTATGCTGATATCCAGGG
CTGGTCAGTTTCATGCCAGCCACCATGGCCATACGATTAACCCAAGCTAATGGAACACTGCATAAAGAGT
GTGTAAGTTCTGCTCTCACTAAGGCTAAACTCCATCTAAGTTGTAAAAAACTCCAGCTGAAAAACAATAT
ACTATGAAGGTGGTTTTATTATCCTGAAGGCACAATAGCCAAGACCCAAACAGGAATTAGATAACACACT
ATGCTCAGCCCTAAACTCTAATAGTTACATTAACAAAACCACCAGAATACTACAAGCAACAGCTTAAAAT
TTAAAGGACTTG

.................

'ChrY:8297560..8299854'Back
mtDNA 1161-3459

tRNA-leu(UUR)  NT_011896.9|HsY_12053  chromosome  Y  5590108-5590181  (8299628-8299701)    
               GTTAAGA TG GCAG AACCTGGCAG  TTTC A TAAAA CTTAAAG .TTTA TAATC AGAGG TTCAACT CCTCT TCTTAAC A

val
leu(UUR)

aaaaattaaaggactcagcggtgctttatatccctctagaggagcctgttttttaatcaa
taaaacctgatatacctcaccacttcttgcccccaacctatatatccccctctttagaaa
accctaaaatggttatagagtaagcacaagcatacccacaaaaatgttagatcaaggtgt
agctcctgagctggcaagaagtggactacattttctgtacccagaatatctcataacaac
ttctatgaattctaagggctcaaggagaatttagcagtaaaccaagagcagagtgcttgg
ttgaataaggccatgaagcatgcatataccacctgtcaccctcctcaaatattattctag
aaattactattactgaaaattctccatgcacttataaaggagctccatgacaaaatggta
agcatactgaaaagtgtgcttggacaaacaaaagtgtagtttaacccaaagcatctggct
tactcccagaagatgtcatcacaacctgatcacattgagccagctctagtcccaaacctc
tctaaaaatataataaactatcttaatcatactatttatcttagacaaaagtataggtga
taaatttttttaccctggtgcaatagacatagtaccataaggaaaagatgaaaaaactga
ataaagcattagaaggcaaaaacaaacccttttatattctgaataatgtattgactagaa
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gctaaaagagcacagagtaggaagattcatgagtagcagtgacaagcctactgagactgg
tgatatctggtggtccaagatagaatcttagttcaacttatacttacccacagaattact
taaactccctgtaagtttaaatgttattctaaagagggacagctctttagaccttaggaa
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attaggaaagcattcaagctaaacatccaattaccttaaattctaatcaccacactaaac
tttaatatcactttggactaacttattacttaatataagcaataatgttaatataagtaa
catgaaaatattcttctttggataagcttatgtgagactggaataattcactgatagtta
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acaggtatgctctaaggaatgattaaaaaaactaaaaggaactcagcaaatcttactctg
gctgtttaccaaaaacttcacctctagcattatcagtattacaaacactgcctgtccagt
gaaaaatgttcaatgaccatggtatcctgaatggacaaaggtagcatagttacttgttcc
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gtgaaattggtgacctatccatgaagatgtggatataaacaaataagatgaggagaccct
atggaactttaattcattaatgtaaataaaaactcaaaaaatcctccagaccctagtgta
ctatcgctgcattaaaaatttgggttatggtgaccttggaccataatttaaactttgcac
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aataggattatgacctattgaccttcatgtttgataaggacatgctaatggtgtagccag
tattaaggattcttttgttcagtgattaaagtcctacatgatttgagttcagaccagagt
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gggcccacttcataaagcaccctcaccccacagatgatgttatcttactctaatatatca
ccatgcaccctacccaagagcagggtttgttaagatggcagaacctggcagtttcataaa
acttaaagtttataatcagaggttcaactcctcttcttaacaacatgcctataattaact
ttgtccaacttattactcccactctaattgctatagcattctttacgctcattgaacaaa
atatcttaggctatatacaacaatgcaaaagacttaacactgtaggtcctacggactgat
tcaaccattcactga

.................

'ChrY:8299879..8300755'Back
mtDNA 4058-4960

tRNA-ile       NT_011896.9|HsY_12053  chromosome  Y  5590558-5590618  (8300078-8300138)  
               AAATA TG TCT GACAAA     ATA A TTACT TTGACAG AGTAA ACAAT AGGTG TTAAAAT  CCTCT TA
tRNA-gln       NT_011896.9|HsY_12053  chromosome  Y  5590622-5590692  (8300142-8300212)
               C TAGAA.T ATAGG AATTGAA CCTGC ACCT GAGAA TCCAAAA TTCTC T GTGC TACCTATT   ACAC CA CGTCCTA
tRNA-met       NT_011896.9|HsY_12053  chromosome  Y  5590696-5590755  (8300216-8300275)
               TAAGG TC AGCT AAATA AGCT A TCAGG CCCATAC ACTAA AAAT GTTGG TTATAT  CCTTC CC


ile
gln
met

tcaccagaactctatatcacaaattttattacaaagaccttcttttacccaccttgtttt
tataaattggaagagcatacctccaatttaactgtgaacacctcacacattttctatgaa
aaaaaatttctatcacttacactagcattctgcatatatcacaatgtctgtcctaatttt
gagcattacaccccaaagaaaatatgtctgacaaaataattactttgacagagtaaacaa
taggtgttaaaatcctcttatctctagaatataggaattgaacctgcacctgagaatcca
aaattctctgtgctacctattacaccacgtcctaaattaaggtcagctaaataagctatc
aggcccatacactaaaaatgttggttatatccttcccaaagtaattaatccattagttca
acttattatctccattactattttcacagaaacccttatcacaatgctagacttacactg
atttctcatttgaatggaaatagaaataaatataattgattttacctcaatctccattaa
aaaataagtttctgctctagagaagcagccaccaaatatttgtttacacatacaactgca
tctataattctcatgataggtattctttccaataaactttcctccaggcaatgaatacta
ttaatcaaatttacccttaataataataactgccctagtaatacgactcagaatagcccc
cttacttctaagtcccagagataacccaaagaacctctcttatatctggcataattctcc
tcacatgagtaaactagcctgtatctcgattatgtttcaaatcttccatcaatgaacatg
aacatcctcctatctatcaagaacctatccattatag

.................

'ChrY:11747774..11748729'Back
mtDNA 9387-10303

gly

ttgtttgaagggctcacagtaagggtagtagtagggcgagttctaactcaaataggggaa
atgtgatggctactagaaagaattttatggagaagagaatgtgggcagaagatagagggt
caaatctgcattcataagggctagatttttctatatatatttattttatacatatatata
tatatttttttctctctctatatatatatattaagttgtgggagccaaaatgtaataatt
attagtaacagggctaatagggtgttgattactagggttaatgttaggtgaattactgtt
tttcggatgctatcgaaactttggaaatcatggtactatttatactaaaagagtaagatc
ctcatcaataaatagaaacatacaagaatagtcatactacatctacaaagtgtcgatatc
aggcagcagcttcaaaggcaaagtgatgactagatgtaaagtggtattttagttggcgga
gaaggcagactgaggaatgttgatccaataatgacgtgaagtctgtgaaagcctgtagct
ataaaaaatgttgagccataaataccatcagaaatagcaaagggagctttgaagtattct
gagacttgtaggagggtgaagtagatacctaatataattgtaataagtagtgcttggatt
gtatgtttttcattattttttgttaggctgtgatgggctcaagtaattgaaactcctgat
gcaagtaatacagatggattcaggaggggtacttccagggtgtcaaggggagaaatacct
gtcgggggtcaatgtcctcctaattctggagtaggggctaggctagaatggtagaatgct
caaaagaatccagcgaagagaaatatttctgagataataaataggactatcccatattgg
aggcctttttgaacagtcgttgtatggtggccctgaaatgtactttctctgataca

.................

'ChrY:11748742..11750087'Back
mtDNA 5614- 6983

tRNA-asn       NT_113819.1|HsY_111538 chromosome  Y    94832-94900  
               C TAAATTG ATGAG ACTTAAA CCCAC GAAAA C.... TTAACAG CTAAA C TCCC TAGTCAAC  TGGT TT GAATCTA
tRNA-cys       NT_113819.1|HsY_111538 chromosome  Y    94936-94993
               GCAGG ATTGAA    GCTGC TTCT TTGAA TTTACAA TTCAA C GTGA  AAA  TCAC CT TGGGACT
tRNA-tyr       NT_113819.1|HsY_111538 chromosome  Y    94993-95059
               T GGTAAAA ACAGG CCTTGA    CCTCT GTTT TTAGA TGTACAG TCTAA T GCCC TACT  TAGT CA TTTTACC

asn
cys
tyr

TCAATTGAATACAGATCAATCACTTTAAGTAAGCTAAGTTCTTACTAAATTGATGAGACTTAAACCCACG
AAAACTTAACAGCTAAACTCCCTAGTCAACTGGTTTGAATCTACTTCTCCAGCCGCTGGGGGATAAAAGG
TGAGAGAAGCAGGATTGAAGCTGCTTCTTTGAATTTACAATTCAACGTGAAAATCACCTTGGGACTGGTA
AAAACAGGCCTTGACCTCTGTTTTTAGATGTACAGTCTAATGCCCTACTTAGTCATTTTACCCTTTTTTC
TCACTTCATTTATGTTGGCTGACAGTCGACTATTCTCAACCAACCATAAAGATATCGGGACATTATATTT
ATTATTTGTCACATAAGCAGGGATAGTCAGTACAGCTTTAAGACTTATTCGAGCTGAACTCCACTAGATG
ATCAAATTTATGTCATTGTTATAGCCTATGCATTTGTCATAATTTTCTTTATAGTAATACTATAATTGGA
GGTCTTGGCAACTGATTAGTCCCCCTGATAATTGGCGCCCCGATATAGCATTTCTCTGCATAAATAATAT
GAGCTTCTGACTCCTCCCACCCTCCTTCCTATTATTACTTGCATCCACTATAGTAGAAGCCGGCACTGGA
ACCGGCTGAACAGTCTCTCCTCCCTTAGCAGGAAACCTAACACATTCAGGCGCCTCTGTAGATTTCACTA
TCTTTTCACTCCACTTGGCAGGTGTTTCTTCTACCTCAGGGGCTATTAACTTTATTACCACAATTGTTAA
TATAAAACCCCCAGCCATGTCCCAATATCACACACCCCTCTTCATCTAATTAGTCCTAATTACAGCAGTT
CTTCTACTCCTTTGTCTCCGAGTCCTAGCCTCTGGCATCACTATATTGTTAACTGACCTCAATCATAATA
CTACTGTTTTCTACCTGGCTGGCGGAGGTGATCCTATCTTATGTCAGCATTTATTCAGATTCTTTGGTCA
CCCTGAAGTCTAAATCCTCATCCCACTGGGCTTTGGGATAATTTCCCACGCCATAACACACTATTCTGGG
AAAAAAAAGAACCATTCAGGTTTATGGGTCTAGTGTGAGCTATAGGATCAGTTGGGTTCTTACGGTTTAT
TGTATGGGCCCACCATATATTTACGGTACGGATAGATGTGGACACATGAGCCTGCTTCACCTCTGCTACT
ATAATTATTGCTATTCCTACTAGCGTCAAAGTTTTTAGCTGACTAGCTAGCTACACTTCACGGCGGTAAT
ATCAAGTGATCCCCCACAATGCTGTGAGCCCAGGGATTTATTTTCCTTTTTACAGTAGGAGGCCTA
............................