HUMAN NUMT's Chromosome 1
Chromosome Y << >> Chromosome 2
mtDNA range mtlen Chromosome Coordinates chrlen Blast score
3915-9756 5842 Chr1: 554327..560167 5841 98%
909-1119 211 Chr1: 9557274..9557474 201 81%
8935-9008 74 Chr1: 37849935..37850008 74 100%
3230-3300 71 Chr1: 47062536..47062606 71 no score
7303-7681 379 Chr1: 55611530..55611912 383 72%
12032-12341 } 310 Chr1: 94160125..94160420 296 71%
6839-7681 } 843 Chr1: 94165620..94166452 833 70%
5567-6110 } 544 Chr1: 94171893..94172420 528 69%
4700-4892 } 193 Chr1: 94173182..94173372 191 66%
2426-3108 } 683 Chr1: 94174550..94175228 679 74%
12478-12520 43 Chr1:103965301..103965343 43 100%
5856-9329 3474 Chr1:107146774..107150235 3462 73%
5614-6983 1370 Chr1:141732720..141734060 1341 74%
989-1509 521 Chr1:141734124..141734640 517 85%
5614-6980 } 1367 Chr1:142085331..142086673 1343 74%
9395-10303 } 909 Chr1:142086693..142087641 949 74%
9395-9826 } 432 Chr1:142184340..142184772 433 77%
5614-6980 } 1367 Chr1:142184792..142186135 1344 74%
15039-15088 50 Chr1:142186130..142186179 50 80%
989-1507 519 Chr1:142186202..142186716 515 83%
6871-6982 112 Chr1:145799428..145799539 112 88%
5588-5655 68 Chr1:170946293..170946365 73 79%
12144-12537 394 Chr1:179658544..179658937 394 77%
612-941 330 Chr1:189145480..189145813 334 71%
875-1183 309 Chr1:190197446..190197745 300 71%
9564-9602 39 Chr1:213739762..213739800 39 100%
9782-13593 3812 Chr1:233768514..233772288 3775 74%
575-6203 } 5629 Chr1:236170686..236176314 5629 78%
12-239 } 228 Chr1:236176999..236177232 234 69%
12157-16571 } 4415 Chr1:236177243..236181644 4402 72%
582-663 82 Chr1:247165189..247165271 83 77%
.................
'Chr1:554327..560167'
top
mtDNA 3915-9756
NT_004350 43096-48936
tRNA-ile NT_004350.18|Hs1_4507 chromosome 1 43445-43513
AGAAATA TG TCT GATAAA AGA G TTACT TTGATAG AGTAA ATAAT AGGAG TTTAAAT CCCCT TATTTCT A
tRNA-gln NT_004350.18|Hs1_4507 chromosome 1 43511-43582
C TAGGACT ATGAG AATCGAA CCCAT CCCT GAGAA TCCAAAA TTCTC C GTGC CACCTATC ACAC CC CATCCTA
tRNA-met NT_004350.18|Hs1_4507 chromosome 1 43584-43651
AGTAAGG TC AGCT AAATA AGCT A TCGGG CCCATAC CCCGA AAAT GTTGG TTATAT CCTTC CCGTACT A
tRNA-trp NT_004350.18|Hs1_4507 chromosome 1 44694-44761
AGAAATT TA GGTT AAATACA GACC A AGAGC CTTCAAA GCCCT CAGT AAGTT GCAA TACTT AATTTCT G
tRNA-ala NT_004350.18|Hs1_4507 chromosome 1 44769-44837
T AAGGACT GCAAA ACCCCAC TCTGC ATCA ACTGA ACGCAAA TCAGC C ACTT TAATT AAGC TA AGCCCTT
tRNA-asn NT_004350.18|Hs1_4507 chromosome 1 44839-44911
C TAGACCA ATGGG ACTTAAA CCCAC AAACA CTTAG TTAACAG CTAAG C ACCC TAATCAAC TGGC TT CAATCTA
tRNA-cys NT_004350.18|Hs1_4507 chromosome 1 44943-45008
A AGCCCCG GCAGG TTTGAA GCTGC TTCT TCGAA TTTGCAA TTCAA T ATGA AAA TCAC CT CAGAGCT
tRNA-tyr NT_004350.18|Hs1_4507 chromosome 1 45008-45073
T GGTAAAA AGAGG CTTAA CCCCT GTCT TTAGA TTTACAG TCCAA T GCTT CACT CAGC CA TTTTACC
tRNA-ser(UCN) NT_004350.18|Hs1_4507 chromosome 1 46629-46697
C AAAAAAG GAAGG AATCGAA CCCCC CAAA GCTGG TTTCAAG CCAAC CC CATG GCCTC CATG A CTTTTTC
tRNA-asp NT_004350.18|Hs1_4507 chromosome 1 46701-46768
AAGATAT TA GAAA AACCA TTTC A TAACT TTGTCAA AGTTA AATT ATAGG CTAAAT CCTAT ATATCTT A
tRNA-lys NT_004350.18|Hs1_4507 chromosome 1 47476-47545
CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
Mutation list:
A4104G C4312T C4318T C4456T T4736C A4769G T4856C C4904T C4914T C4940T
A4958G G4991A T5041C G5147A C5320T A5351G C5387T T5426C G5471A A5474G
A5498G T5580C G5821A C5840T G6023A T6221C C6242T A6266C A6299G G6366A
G6383A C6410T C6452T C6483T T6512C C6542T C6569A T6641C A6692G 6698.1A
C6935T C6938T A7146G C7232T C7256T G7316A G7521A C7650T T7705C C7810T
C7868T C7891T G7912A A8021G G8065A C8140T G8152A T8167C C8197d A8198d
C8203T G8392A C8455T C8461T T8503C G8545A C8655T A8677C A8701G A8718G
A8860G C8943T C9060A C9075T C9168T A9254G T9325C G9329C A9434G C9527T
T9530C T9540C A9545G G9548A A9629G
Mutation count = 85
Mutation rate = 14.5 mutations/1000bps
gggagtccgaactagtctcaggcttcaacatcgaatacgccgcaggccccttcgccctat
tcttcatagccgaatacacaaacattattataataaacaccctcaccactacaatcttcc
taggaacaacatataacgcactctcccctgaactctacacaacatattttgtcaccaaga
ccctacttctgacctccctgttcttatgaattcgaacagcatacccccgattccgctacg
accaactcatacacctcctatgaaaaaacttcctaccactcaccctagcattacttatat
gatatgtctccatacccattacaatctccagcattccccctcaaacctaagaaatatgtc
tgataaaagagttactttgatagagtaaataataggagtttaaatccccttatttctagg
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gtacaaccctaacataaccattcttaatttaactatttatattatcctaactactaccgc
attcctactactcaacttaaactccagcaccacaaccctactactatctcgcacctgaaa
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actatacctattattcggcgcatgagctggagtcctaggcacagctctaagcctccttat
tcgagccgaactgggccagccaggcaaccttctaggtaacgaccacatctacaacgttat
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atctctcccagtcctagccgctggcatcactatactactaacagaccgtaacctcaacac
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cagtgctctgagccctaggatttatttttcttttcaccgtaggtggcctgactggcattg
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tccactatgtcctatcaataggagctgtatttgccatcataggaggcttcattcactgat
ttcccctattctcaggctacaccctagaccaaacctacgccaaaatccatttcgctatca
tattcatcggcgtaaatctaactttcttcccacaacactttctcggcctatccggaatgc
cccgacgttactcggactatcccgatgcatacaccacatgaaatatcctatcatctgtag
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cctcaccaaagcccataaaaataaaaaactataacaaaccctgagaaccaaaatgaacga
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cattctatttccccctctattgatccccacctccaaatatctcatcaacaaccgactaat
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cctcctcggactcctgcctcactcatttacaccaaccacccaactatctataaacctagc
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ttactcgcatcaggggtatcaatcacctgagctcaccatagtctaatagaaaacaaccga
aaccaaataattcaagcactgcttattacaattttactgggtctctattttaccctccta
caagcctcagagtacttcgag
................
'Chr1: 9557274..9557474'
top
mtDNA 909-1119
acaattaacccaagctaatggaacccggtgtaaagagtgttttagacttaataaagctaa
gcttcatctaagttgtaaaaaaccctagctgaaataaaataaactatgaaggtggcttta
atacttctgaagacacaatagctaagacccaaattgggattagataccccactatgctta
gccctaaactccaatagttaa
.................
'Chr1:37849935..37850008'
top
mtDNA 8935-9008
ccttatccccatactagttattatcgaaaccatcagcctactcattcaaccaatagccct
ggccgtacgcctaa
.................
'Chr1:47062536..47062606'
top
mtDNA 3230-3300
tRNA Leu(UUR)
gttaaggtgacagagctggtaattgtgtagaacttagacttataatcagaggtgcaactc
ttctgcttaac
..............
'Chr1:55611530..55611912'
top
mtDNA 7303-7681
Ser(UCN)
Asp
TTAATAATCTTCATAATCTGAGAAGCCTTTGCTTCAAAACGAGATGTTTCAGTAGTTGA
ACTATCAACTACAAACCTAGAATGACTTTACAGCTCCCTGCCACCATATCTCACATTTG
AAGAACCTGTTTATGTGAAAGC CTAGAAGAGAAAGGAAGGAATTGAACCTCCCAAAAC
TGGGTTTAAGCCAACTTCGTAACTACGATGACTT TCTCGGTTAAGAGTTACTATAGTA
AAATAATCATATAACTTTGCCAAAGTTAATTTACATGTTAGAACCC TTTCTATCTTCA
GGGCATATCCATTTCAATTAGGCTTCCAAGATGCTATGTCACCTATCACAGAACTCCTT
CACTTTCATGACCACACCCTAATAATTGTTTT
..............
'Chr1:94160125..94160420'
top
mtDNA 12032-12341
His
Ser(AGY)
Leu(CUN)
ttattgcttttatttggagttacactcatttttttagctcctaactccagcggattattt
ctatgctttaaaagttgaaaaacaatattattctacatggaggcatgagttagtagtttt
tgcttactttctcagtaaataaggagttttaggcttctgttgttttagtcacaatataat
gttttgtttaacaatatttataatatatgggtactagaatagtttgggggttgtgatagg
agaagaaatatataagtattagaatatttttctcgtgtgaatgatggtttaatgtt
............
'Chr1:94165620..94166452'
top
mtDNA 6839-7681
Ser(UCN)
Asp
aatataattattaaagcgtgatcatggaaatgcaaaagttcttctgtaataggtaatgct
gcatcttgaagcctaactggaatgggtatgccataaggatataaaggattttaacttgta
agttaacttcaactaagttatttagtattcttactaatatctcacttgttgagaaagcct
agtggttatgggtctggcttgaaattggttatgtgattttgattcctccctttcttatct
taagcttttacgtaagcaggctcttcaaatgcatgatatgggggtgggcagccataaggt
cattcaaagtttgtaatgaaagccccactactgaggcttctcattttgaagtaaagtctt
ctcaaattatgaaaatttttaatattctgttagtgaaatagaggagcctattgataagat
gatttttcatgttgtatatgcatcaggataattagactattgttatgatatgctggataa
accaaggaaatgttgcagaaagtcaggtttatacgcacaaatataattgtaaaatgaatt
ttggctcaggttcagtgtgtaacctaaaaattgtgagaatcagtgaacaaaccctcctat
aataatgaaaactgctcctgttgatagaacatagtagaaatgtgctacaacataatatgt
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tataaatagagaaatacagcctaaggctcaaaatacagctggagatcatttaatattacc
tccatgtagtgttgctagtcaactagatactttaactcctgtgggaatagtga
..............
'Chr1:94171893..94172420'
top
mtDNA 5567-6110
Ala
Asn
Cys
Tyr
ataaaaaacattattaccagcacataggcagtgatgatgacattataaaatttgatcatc
aactatcagggccactgattgacccatttcagttcaaattaaaagatttaggaaagtttc
tactattccagctcaagcatcaaatagtaaatgcagtgtgttaatacctttgtggtttgt
caagattaatgaatgtagacagtaaggtaaaatggctgagtaagctttagactataaatc
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gatgccactgatctgtctagtaaggatttagcttaattaaggtgtttgatttgcattctg
ctgatgtaagatagagtcttgtgtccttatttttcaggaattaagtat
..............
'Chr1:94173182..94173372'
top
mtDNA 4700-4892
attgaaattggtacccgttttggtcatgttaatgggattatgcctgatattagtggattt
ccttctgttatttctgggactcaaaaatggaatggggagagtccaagttttataactagt
gccacagtaattattagggatgctgttgggttggggatttttatgattgttcattaccca
gagtataatgt
.................
'Chr1:94174550..94175228'
top
mtDNA 2426-3108
gtagttagaaaccaacctggattgctcctatctgaatgcatatcacataggactttaatt
gttaaacaaatgaacaattaacaatgtttacgtcaaagggatgttctgattcaacatcaa
agttgtaaatcctattgtcaatatggactctagaataggattacactgttattcctaggg
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gttttagtccagtaagtacagtgttatgctttataattgggttgtttgcttttatatggt
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gtgaaggccaatttcatggaaagtaagagacagttaatccttcctgtggccattcattca
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ttaaacaggtggcatttgtgtttgctgagatccttttactttttgagatctttccttagg
tgcatgcctgtgttgtgtt
.................
'Chr1:103965301..103965343'
top
mtDNA 12478-12520
aacttcttggtctaggcacatgaatattgttgtggggaagaga
.................
'Chr1:107146774..107150235'
top
mtDNA 5856-9329
Tyr
Ser(UCN)
Asp
Lys
agatttacagtctaatgcttactcagccatttaacctttttccccacttaggttcatcaa
tcattgattgttttcaaataaccacaaagatatcggaacactatacctgctatttggctc
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tgatcatcttctcgctccacttagcaggtgtttcttctattttgggggccattaacttta
ttgccacaattattaacataaaacccccaaccatatcccagtatcaagcatccctttttg
tctgatcaatcctcattaccgcagtccttctactccttttcccccaagtcctagctactg
tcattactatactattaactgactgtaacctcaacactactttttttgaccctgctggtg
ggggtgactttgtctggtaccaatcttgtaccaacatttattctgattgtttggtcacac
tgaagtctatatccttatcctaccaggcttcaggataatcttccacatcataacatatta
ttctggaaacaaaagtaaccatttggttacatgggtatagtagtagtcataatatcaatt
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tacagctaattagctacactgcatggtggtaatatcaaatgacctcctgcaatattctga
gccctaggattcatttttcttttcaaagtaggaagtttaaacggcatcgtactagctaac
tcatcactagacattgtcttacatgacacatattatgttgtagcccatttccgctacgtc
ctatcaataggagcagtattcaccattataggaggctttgtccactgattccccctattt
tcaggttatacacttaatcagacctacgctgatcaaatccacttaatcaaatccacttca
ccattatattcgtaggtgttaatttaacctttttttccacagcacttccttggcctatcc
agtatgcctcgatgttactctgattatcctgatgtgtatgccggatgaaatgttatttca
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............
'Chr1:141732720..141734060'
top
mtDNA 5614-6983
asn
cys
tyr
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..............
'Chr1:141734124..141734640'
top
mtDNA 989-1509
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'Chr1:142085331..142086673'
top
mtDNA 5614-6980
asn
cys
tyr
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...............
'Chr1:142086693..142087641'
top
mtDNA 9395-10303
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.................
'Chr1:142184340..142184772'
top
mtDNA 9395-9826
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.................
'Chr1:142184792..142186135'
top
mtDNA 5614-6980
asn
cys
tyr
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...............
'Chr1:142186130..142186179'
top
mtDNA 15039-15088
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.................
'Chr1:142186202..142186716'
top
mtDNA 989-1507
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'Chr1:145799428..145799539'
top
mtDNA 6871-6982
tgactcactacactccacggaagcaacatgaagtgatctgctgcagtactctgagccctg
ggattcatttttctcttcactgtgggtggcctaaccggcattgtactagcaa
.................
'Chr1:170946293..170946365'
top
mtDNA 5588-5655
ala
gagggcttagcttaattaaagtgattgatttgcagtcaattgatgtaggatagagtcttg
catgcagtcctta
..............
'Chr1:179658544..179658737'
top
mtDNA 12144-12537
His
Ser(AGY)
Leu(CUN)
TATAGTTTAACCAAAACATTAGATTGTGAATCTAACAATAGAAGCCTGCAACTTCTTGTC
TACCGAGAAAGTGTACAAGAACTGCTAACTCATGCCCCCATGCCTAGCAACATGGCTTTC
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TAAAAACATCTATCGCATGTGCCTTCATCATCAGCCTCATCCCTACAACAATGTTTATAT
GTACAGATCAAGAAGTCATTATCTCAAACTGACA
............
'Chr1:189145480..189145813'
top
mtDNA 612-941
Phe
AACATGCCTAGATGAGTTCACGTAACTCCATAAATACAAAGGCTTGTTGGCCCTAACCTT
TTTATTGGCTTTCAGTAAGATTACATATGCAACCATCCCTATTCCAGGGAGAATGATCTC
CAGATCACCTAATATCAAAAGGAGCAGATATCAAGCACACAACA--GGTGCTTTTAATGC
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TTTGATTAAGCTATACTAAACTATCAAGGTTGGCAAATCTTCCGTCAGCCACTGTGGCCA
CATAATTTACCCAAACTAATAAAAACCAGAGTTAAG
.............
'Chr1:190197446..190197745'
top
mtDNA 875-1183
ggttggtaaatttcatgccagccactgcgtcttaaaattaaaccaaattaataaaactcg
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.................
'Chr1:213739762..213739800'
top
mtDNA 9564-9602
aggcatcaccccgctaaatcccctagaagtcccactcct
.................
'Chr1:233768514..233772288'
top
mtDNA 9782-13593
Gly
Arg
His
Ser(AGY)
Leu(CUN)
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............
'Chr1:236170686..236176314'
top
mtDNA 575-6203
phe
Val
Leu(UUR)
Ile
Gln
Met
Trp
Ala
Asn
Cys
Tyr
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'Chr1:236176999..236177232'
top
mtDNA 12-239
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'Chr1:236177243..236181644'
top
mtDNA 12157-16571
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Leu(CUN)
Glu
Thr
Pro
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............
'Chr1:247165189..247165257'
top
mtDNA 577-647
NT_032968.7|Hs1_33144 140356-140424
phe
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Last revised 27 December 2008