mtDNA range    mtlen     Chr. Coordinates Build 37.3    chrlen    Blast score   HSA number      HSA Coordinates

  4537-6446      1910     Chr21:36184442..36186292         1851        65%
 15843-16030      188     Chr21:39904788..39904978          191        70%
 15888-16018      131     Chr21:44714101..44714231          131     no score

 14770-15172  }   403     Chr21:44716410..44716799          390        69%
 14427-14742  }   316     Chr21:44717141..44717454          314        69%
 13988-14234  }   247     Chr21:44717966..44718202          237        70%
 13398-13654  }   257     Chr21:44718521..44718774          254        68%
 12259-12957  }   699     Chr21:44718823..44719486          664        65%

  3752-3892       141     Chr21:(NT_113952)157896..158036   141        76%
  9395-10142      748     Chr21:(NT_113954) 87813..88552    740        78%
  5614-6980      1367     Chr21:(NT_113954) 88572..89909   1338        74%
  5738-5897       160     Chr21:(NT_113955) 51800..51959    160        98%


HSA_NumtS_562   12643..12710	45244827..45244894



.........

'Chr21:36184442..36186292'top
mtDNA 4537-6446

tRNA-trp       NT_011512.10|Hs21_11669  22925340-22925275  chromosome 21 
(5512- 5579)   AGGAATT TA GGTT AGGCA       GACC A AAAGC CTTCAAA GCCCT AAGC AATAT TTTA.   TATTT TATTCCT G
tRNA-ala       NT_011512.10|Hs21_11669  22925268-22925198  chromosome 21
(5587-5655)    T AAGGACT GCAAC ACTCTCTAT   CTTAC ATCA ATTGA ATGCAAA TCAAA C ATTT TAATT  AAAC TA AATCCTC
tRNA-asn       NT_011512.10|Hs21_11669  22925196-22925136  chromosome 21
(5657-5729)    T TAGATTG GTAGT ATCCAAC CTCAA GAAAA TTTCA TTAACAG TGAAA T ACCC TAATCACC  TGTC TT CAGTCTA
tRNA-cys       NT_011512.10|Hs21_11669  22925094-22925024  chromosome 21  
(5761-5826)    A AGCCCTG GCAGA ATTGAA    GCTGC ATCT TTGAG TTTGCAA TTTGA T GTGA CTAT  TCAC CT TGAGGCA
tRNA-tyr       NT_011512.10|Hs21_11669  22925027-22924963  chromosome 21 
(5826-5891)    C AGTAAAA AGAGG  GTTCAA   CCTCT GTCT TTAGA TT.ACGG ATTAA G GCTT .CCT  CAGC CA TTTCACT

trp
ala
asn
cys
tyr

gtctgatattgggatatgactggtggtgttatattcataattgttgtaataaaattagta
actcctaaaattaatggaatacctgcgaagcgtaatgagaaaattgtaagaggctcctgc
gtgtgctaaatttccaactaaagctgcttatcctgtcccagctccagcttctactagtaa
aggggcaagcagaagtcaaaacgatggtgaaaaaagtcagaagcttatattgtttataag
agaatgctgtatctcggctcagtcatttagggagctaatcagttaccaagtcctcttatt
ttaattggcatatccattaaaagattattacaaatgcatgggcagttataatgacataaa
tttgatcattgcctaatagggctcctggttgacccagtttggctcatattaagagattta
tgtcagttcctactactctggctcaagcaccgaatactataatgtgccaatatctttgtg
tttgttgaaaataatcaatgattaatcaatataggtagaagagtgaaatggctgaggaag
ccttaatccgtaatctaaagacagaggttgaaccctctttttactgtgcctcaaggtgaa
tagtcacatcaaattgcaaactcaaagatgcagcttcaattctgccagggcttcccctgc
ccttttctctcaacagcagaagtagactgaagacaggtgattagggtatttcactgttaa
tgaaattttcttgaggttggatactaccaatctaatgaggatttagtttaattaaaatgt
ttgatttgcattcaattgatgtaagatagagagtgttgcagtccttaatttttcaggaat
aaaatataaaatattgcttagggctttgaaggcttttggtctgcctaacctaaattccta
atccaatgttgagaatactggtttaagtgggaagaaaaaggctgataacaaaataagcga
gggaaggaagaatgtttattttatattttcaaattgtcattttgtttttatgttattggt
tttggggaacgtctttaatgatgtagaatagattaatcccatacaaaaacataagttgag
tagggctttgatggtgataaatgttagtataataacgctgttattttttgttaattcttg
gctaataagtcatttggtaaaaatcgtgtaagaggaggtaggtcttttggagataataga
aatataaagatatgggagttattagtgataacttaccccatgtatgtaataatgataatg
tatgggagttatatttaaattgaataaatatgaatacagtgattattaatattttgtaat
tagtagatgtaacattattgtagaaaggttgtaggttagagtggacattatttagtctat
atgtgcaattaataggccagaattttgtatagttatgcctgatttagtcttcctcattct
cctatcagaattgataatatagcagtaattaatattacatttgggttaattgatgatact
tggaattgagattagtgccagtttttgtcatattaataagattatgcctgatgttattgg
aattccttgtcttacttctgggactcagaaatggaatggagaaagcccactttttataat
tactgttatagtgattattacagatgctattgggttgggaatttttatgattgttcacta
cccagaatatgatatatcaagacacctactattaggactgtagatgcagttgtgttaaga
aatatttagtagctgcttctttggatcatgaatttaattttttattaaaatgagaataat
ggctagtacatttatttctagtcctattcagattattaatcagtgcaagct

.........

'Chr21:39904788..39904978'top
mtDNA 15843-16030

tRNA-thr       NT_011512.10|Hs21_11669       26644834-26644902 chromosome 21
(15888-15953)  GTCATTG TA GTAT AATTAAA TTAC T CTGGT CTTGGAA ACAAA AAAT GGAGG ACCCT   CCTCC  CAAGGAC A
               ATT
tRNA-pro       NT_011512.10|Hs21_11669       26644906-26644972 chromosome 21
(15956-16023)  T CAGGGAA GAAGC TTCCA   GCTCC ACCA CCAGC ACCCAAA GCTGA A ATTC TA.CCT  GAAC GA TTCCCTG

thr
pro

ataccacttactagcctaattgaaaacaagctgctcaaatgaagaagtcattgtagtata
attaaattactctggtcttggaaacaaaaaatggaggaccctcctcccaaggacaatttc
agggaagaagcttccagctccaccaccagcacccaaagctgaaattctacctgaacgatt
ccctgattttt

.........

'Chr21:44714101..44714231'top
mt DNA 15888-16018
  
tRNA-thr       NT_011515.11|Hs21_11672        1207139-1207071  Homo sapiens    chromosome 21
(15888-15953)  GTCCTTG TG GTAT ATTTATG TGAC T CTGGT CTTGTAA ACCAA AAAT GGAGA GCACT   CCTCC  CTAGGCC A
               AA
tRNA-pro       NT_011515.11|Hs21_11672        1207069-1207009  Homo sapiens    chromosome 21
(15956-16023)  T TCGAGGA AGAAG CTATCT  GCTCC ACCA CTGGT ACCCAAA GCGT. G ATTC TACTTT  ACCC CC TGACATT

thr
pro

gggggtaaagtagaatcacgctttgggtaccagtggtggagcagatagcttcttcctcga
attggcctagggaggagtgctctccatttttggtttacaagaccagagtcacataaatat
accacaaggac

.........

'Chr21:44716410..44716799'top
mtDNA 14770-15172

cctcaaaaagacatttgtcttcatggtagggcgtagcctatacatgctgttgctatcact
gccaatagcagaaatgatgtcaatgtttccggtttccagaaaagtgtaggacccctggga
taagcctcttcctacatatataaataggcagatgagaatattgatgtcaatgtcagataa
ctcagccataatttacatctcagcagatatgtgcaacagaggaaaatgcagttactgtat
ctggtgtataatgtatagctagaaaaagtcctgtaatgatttctagggctcggcagaccc
ctaaaagtgagccgaaattccatcatgcagagatagttgatggcactgggaagtcagtga
agaagtggttgataatttttattaggtggt

.........

'Chr21:44717141..44717454'top
mtDNA 14427-14742

tRNA-glu       NT_011515.11|Hs21_11672        1210116-1210048  chromosome 21
               A ATTCTCA CATGG CATTTAA CCATG ACTA  ATGAT GCAAAAA ATCAT C ATTG TATTT CAAC TG TAAGAAG
glu

ttcttacagttgaaatacaatgatgattttttgcatcattagtcatggttaaatgccatg
tgagaattatgacatacaacatatttttattaagtacaatgtttgttgtaggttttgtgg
gtttctcttcaaaacctttgccagttttggggggtttgggttaattattagtggaagggt
gggttgtggtattgtattaaaggtcagtggtgcatttataggattaggagtatttttaat
ttatttgggggaatgatagtgatgtttggatgtaccgcggcaacagctactgagggttat
cctgaggcttgggg

.........

'Chr21:44717966..44718202'top
mtDNA 13988-14234

ttatggtagttggttgatggtggtggctggttgatctttatttgttaggatttttattgt
aactgaagttactcaagggtattgattaggagtgtggctaggaaagtggggtgaggaaag
agagaaagtaaagtttgattaggcctttttggttggatacagttgttgaggttagtgttt
ggagctgcgttgcatttgttggtattgttgttctattcagatcaggtctagctggag

.........

'Chr21:44718521..44718774'top
mtDNA 13398-13654

ggttgtgaagccaggttgctctaagagcgggaagacagcattcgagtgtgaaggcagctg
tgagggaggaggcgaggggcagaatcaggagggcgcaggtgtgggtatatgtgtgtttgt
ggttttgacgatcaggtctttggagcaggtgcccccgaggaaaggtgcacacatgcgcgc
aaggctgccggtgacgtgtgaggacgaggtcaagggtaaggctttcaataggccctcatt
tttttgaatgtctt

.........

'Chr21:44718823..44719486'top
mtDNA 12259-12957

tRNA-leu(CUN)  NT_011515.11|Hs21_11672        1212386-1212317  chromosome 21  (44719409-44719478)
(12266-12336)  ACTTTTA AA GGAT AGAAGTA ATCC A TCGGT CTTAGGA  ATCAA AAAA  .TTGG TGCAACT CCAAA TAAAAGT A

leu(CUN)

ttagggttgagaatgaatatgtgttgaaattctcccgtgttggagcacagtggaaatcat
gctgcaatgaaaccgattctcccatgaggtcgtagaagctgcttgcagggctgctgcgtt
agcctctgctccatcagccaggtggtggaaatgatataatacctactcctccccatctga
tacaagttgaactggatggttggtggtgactaggattagcagcatggtgagaaatatggg
tagatatttaaagaattgattggtattaggatctgagtgcatatgttacattgagaactc
tgtaaatcaccatgtgacaaaaagtgctattggtaataatcgcgtttaaaactaagtgag
agctttcgggtttggatagttattcagggtcagtgtgagataatagttgcttggcccgag
tgaataaacatgagagctggggtaattctggtaatgaagtttgcacactgtggacgtctt
tactgaattgggtaggcgttatctcgacaggtgctggttgagtaataacagttggtgaag
tcaataagattcatgaagttagaatgaaagaggagaatacatttattacttttatttgga
gttgcaccaattttttgattcctaagaccgatggattacttctatcctttaaaagttgag
agag

.........

'Chr21:(NT_113952)157896..158036'top
mtDNA 3752-3892

TCGATTAGTTTCTGCTAGTGTGGGGACAAGTCTTATCATGGCTAGGGGCCACGATGGTAGGAGCAGTCAG
AGGATTTCTTGCATTGTGATGAGTGCATATAAGTTAAATGAGCCACTTATCAGTAGATTTGATAGCAGGA
T

.........

'Chr21:(NT_113954) 87813..88552'top
mtDNA 9395-10142

gly

TTAAGTTGTGGGAGCCAAAATGTAATAATTATTAGTAACAGGGCTAATAGGGTGTTGATTACTAGGGTTA
ATGTTAGGTGAATTACTGTTTTTCGGATGCTATCAAAACTTTGGAAATCATGGTACTATTTATACTAAAA
GAGTAAGATCCTCATCAATAAATAGAAACATACAAGAATAGTCATACTATATCTACAAAGTGTCGATATC
AGGCAGCGGCTTCAAAGGCAAAATGATGACTAGATGTAAAGTGGTATTTTAATTGGCGGAGAAGGCAGAC
TGAGGAATGTTGATCCAATAATGATGTGAATTCTGTGAAAGCCTGTAGCTATAAAAAAATGTTGAGCCAT
AAATACCATCAGAAATAACAAAGGGAGCTTTGAAGTATTCTGAGACTTGTAGGAAGGTGAAGTAAATATC
TAATATAATTGTAACAAGTAGTGCTTGGATTGTATGTTTTTGATTATTTTTTGTTAGGCTGTGATGGGCT
CAAGTAATTGAAATTCCTGATGCAAGTAATACAGATGGATTCAGGAGAGGTACTTCCAGGGGGTCAAGGG
GAGAAATACCTGTTGGGGGTCAATGCCCTCCTAATTCTGGAGTAGGGGCTAGGCTAGAATGGTAGAATGC
TCAAAAGAATCCAGCGAAGAGGAATATTTCTGAGATAATAAATAGGACTGTCCCATATTGGAGGCCTTTT
TGAACAGTTGTTGTATGGTGACCCTGAAATGTACTTTCTC

.........

'Chr21:(NT_113954)88572..89909'top
mtDNA 5614-6980

tRNA-asn       NT_113954.1|Hs21_111673  chromosome 21     88611-88684 
(5657-5729)    C TAAATTG ATGAG ACTGAAA CCCAT GAAAA C.... TTAACAG CTAAA C TCCC TAGTCAAC  TGGT TT GAATCTA
tRNA-cys       NT_113954.1|Hs21_111673  chromosome 21     88720-88777
(5761-5826)    GCAGG ATTGAA    GCTGC TTCT TTGAA TTTACAA TTCAA C ATGA  AAA  TCAC CT TGGGACT
tRNA-tyr       NT_113954.1|Hs21_111673  chromosome 21     88777-88843
(5826-5891)    T GGTAAAA ACAGG CGTTGA    CCTCT GTTT TTAGA TGTACAG TCTAA T GCCC TACT  CAGT CA TTTTACC

asn
cys
tyr

TCAATTGAATACAGATCAATCACTTTAAGTAAGCTAAGTCCTTACTAAATTGATGAGACTGAAACCCATG
AAAACTTAACAGCTAAACTCCCTAGTCAACTGGTTTGAATCTACTTCTCCAGCAGCTGGGGGAAAAAAGG
TGAGAGAAGCAGGATTGAAGCTGCTTCTTTGAATTTACAATTCAACATGAAAATCACCTTGGGACTGGTA
AAAACAGGCGTTGACCTCTGTTTTTAGATGTACAGTCTAATGCCCTACTCAGTCATTTTACCCTTTTTTC
TCACTTCATTTATGTTGGCTGACAGTTGACTATTCTCAACCAACCATAAAGATATCGAGACATTATATTT
ATTATTTGGCACATGAGCAGGGATAGTCAGTACAGCTTTAAATTCGAGCTGAACTCTACTAGATGATCAA
ATTTATGTCATTGTTATAGCCTATGCATTTGTCATAATTTTCTTTATGGTAATACTATAATTGGAGGTCT
TGGCAACTGATTAGTCCCCCGATAATTGGCGCCCCCGATATAGCATTTCTCTGCATAAATAATATGAGCT
TCTGACTCCTCCCACCCTCCTTCCTTTTATTACTTGCATCCACTATAGTAGAAGCCGGCACTGGAACCGG
CTGAACAGTCTCTCCTCCCTTAGCAGTAAACCTAACACATGCAGGCGCCTCTGTAGATTTCACTATCTTT
TCACTCCACTTGACAGGTGTTTCTTCTACTTCAGGGGCTATTAACTTTATTACCACAATTGTTAATATAA
AACCCCCAGCCATGTCCCAATATCACACACCCCTCTTCATCTGATTAGTCCTAATTACAGCAGTTCTTCT
ACTCCTTTGTCTCCGAGTCCTAGCCGCCGGCATCACTATATTGTTAACTGACTGCAATCTTAATACTACT
TTTTTCTATCTGGCTGGCGGAGGTGATCCTATCTTATTTCAGCATTTATTCAGATTCTTTGGTCACCCTG
AAGTCTACATCCTCATCCCACTGGGCTTTGGGATAATTTCCCACGTCGTAACATACTATTCTGGAAGAAA
AAAGAACCATTCAGGTATATGGGCCTAGTGTGAGCTATAGGATCAGTTGGGTCCTTACGGTTTATTGTAT
GGGCCCACCGTATATTTACGGTAGGGATAGTTGTGGATACATGAGCCTGCTTCACCTCTGCTATTATAAT
TATTGCTATTCCTACTAGCGTCAAAGTTTTTAGCTGACTAGCTAGCTACACTTCACGGCGGTAATATCAA
ATGATCCCCCGCAATGCTGTGAGCCCGGGGATTTATTTTCCTTTTTACAGTAGGAGGCCTAACCAGCATT
GTATTGGC

................

'Chr21:(NT_113955)51800..51959'top
mtDNA 5738-5897

tRNA-cys       NT_113955.1|Hs21_111674  chromosome 21     51935-51870
(5761-5826)    A AGCCCCG GCAGG TTTGAA    GCTGC TTCT TCGAA TTTGCAA TTCAA T ATGA  AAA  TCAC CT CAGAGCT
tRNA-tyr       NT_113955.1|Hs21_111674  chromosome 21     51870-51805
(5826-5891)    T GGTAAAA AGAGG  CTTAA    CCCCT GTCT TTAGA TTTACAG TCCAA T GCTT CACT  CAGC CA TTTTACC

cys
tyr

GGTGAGGTAAAATGGCTGAGTGAAGCATTGGACTGTAAATCTAAAGACAGGGGTTAAGCCTCTTTTTACC
AGCTCTGAGGTGATTTTCATATTGAATTGCAAATTCGAAGAAGCAGCTTCAAACCTGCCGGGGCTTCTCC
CGCCTTTTTTCCCGGCGGCG

..................