'ND3' mutations and comparisons

The gene ND3 is one of the genes encode by mitochondrial DNA.
It is located at Bases 10059 - 10404.(All numbering is from CRS.)

Primate sequences:
                10059
NC_001807 Homo  MNFALILMINTLLALLLMIITFWLPQLNGYMEKSTPYECGFDPMSPARVPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPLMVMSSLLLIIILALSLAYEWLQKGLDWAE
Pan Paniscus    MNFVLILMTNTLLALLLMIITFWLPQLNSYMEKSNPYECGFDPMSPARVPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTANLPLMVMSSLLLITILALSLAYEWLQKGLDWAE
Pan troglodytes MNFVLILMTNTLLALLLMIITFWLPQLNSYMEKSTPYECGFDPMSPARVPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTANLPLMVTSSLLLITILALSLAYEWLQKGLDWTE
Gorilla gorilla MNFALILMTNTLLALLLMIITFWLPQLNSYMEKTNPYECGFDPVSPARIPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPLMVMSSLLLIIILTLSLAYEWLQKGLDWTE
Pongo pygmaeus  MNFVLALTINTLLALLLMILTFWLPQLNPYMEKSDPYECGFDPAYPARIPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPLMTTSSLMLIIILALGLTYEWSQKGLDWTE
Pongo Abelii    MNFVLALTVNTLLALLLMTITFWLPQLYPYMEKSDPYECGFDPAYPARIPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPLMTTSSLMLIIILALGLTYEWSQKGLDWAE
Hylobates lar   MNLALALMINTLLALLLMTITFWLPQLNTYMEKTNPYECGFDPLSPARIPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNPSLTIASSLTLITILILSLAYEWSQKGLDWVE
Macaca Sylvanus MNLALALMTNTLLTSLLTIIMFWLPQLNSYVEKTSPYECGFDPLNPARIPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLSLPWAIQTTNLQTMIKLTIALIIILTLSLAYEWTQKGLDWAE
Macaca Mulatta  MNLVLALTINTLLTSLLMIIMFWLPQLNPYTEKTSPYECGFDPLNPARIPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLSLPWAIQTTNLPMMIKSTIAFIIILILSLTYEWTQKGLDWAE
Papio hamadryas MNLMLALTVNTLLTALLTIIMFWLPQLNSYAEKANPYECGFDPLNPARIPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLSLPWALQTANLPTMIKTSIMFITILALSLAYEWTQKGLDWT  
Cercopithecus   MNLVLALTINTLLTSLLMITMFWLPQLNSYAEKTSPYECGFDPLNPARIPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLSLPWALQTTNLPMMIKSSTTLIIILALSLAYEWSQKGLDWAE
Colobus Guereza MNLVLILTINTLLTLMLMVIMFWLPQLNSYTEKTNPYECGFDPLNPARIPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLSTMIKSSMMLVTILTLSLAYEWTQKGLDWAE
Trachypithecus  MNLVLALTINILLTLLLMIIMFWLPSLNSYAEKANPYECGFDPLNSARIPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPVMIKSSMMLIIILTLGLAYEWTQKGLDWTE
Cebus albifrons MNLMLTLATSTLLALLLITITFWMPQLNKYTEKHNPYECGFDPTTSAHLPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWATQTDNLMLMTNMVFTLLIILALGLAYEWTQKGLDWVD
Nycticebus      MNTMIMLITNTSLASVLVLLAFWLPQLNIYTEKYSPYECGFDPTGSARLPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWAIQTHMLNLMLTMTFLLILILALGLAYEWIQKGLEWQE
Lemur catta     MNLPLALTTSITLTLLLVTIAFWLPQLNVYTEKYSPYECGFDPMGSARLPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWASQTNNLKLMLTVALVLITILAAGLAYEWLQKGLEWVE
Tarsius bancan. MNLIMSLITNMALALLLVSIAFWLPQLNTYTEKSSPYECGFDPTESARLPFSMKFFLIAITFLLFDLEIALLLPLPWATQMTNLSLMMFMALTLISILALGLAYEWTQKGLEWTE
Tupaia          MNLILALVINTSLAALLVTIAFWLPQLNVYMEKYSPYECGFDPMGSARLPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWAIQSNYPTTMLTMALLLISILALGLAYEWLQKGLEWAE
Cynocephalus    MNLTLTLFINSTLALLLITIALWLPQTYIYAEKSSPYECGFDPVGSARLPFSMKFFLVAITFLLFDLEITLLLPLPWATQMDNLTLMLIIALILIITLALSLAYEWSQKGLEWAE

'Human' Mutations found in published genealogical sequences:-
CRS             MNFALILMINTLLALLLMIITFWLPQLNGYMEKSTPYECGFDPMSPARVPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPLMVMSSLLLIIILALSLAYEWLQKGLDWTE

T10084C      ATC>ACC ile>thr
AY882391(Pak.)  MNFALILMTNTLLALLLMIITFWLPQLNGYMEKSTPYECGFDPMSPARVPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPLMVMSSLLLIIILALSLAYEWLQKGLDWTE
A10086G       AAC>GAC asn>asp
AY339467(Eur)   MNFALILMIDTLLALLLMIITFWLPQLNGYMEKSTPYECGFDPMSPARVPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPLMVMSSLLLIIILALSLAYEWLQKGLDWTE
G10143A                          GGC>AGC gly>ser
AY714030(India) MNFALILMINTLLALLLMIITFWLPQLNSYMEKSTPYECGFDPMSPARVPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPLMVMSSLLLIIILALSLAYEWLQKGLDWTE
T10192A & A10398G                                TTC>TAC ser>tyr                                                      ACC>GCC thr>ala
AY289064(Aborg) MNFALILMINTLLALLLMIITFWLPQLNGYMEKSTPYECGFDPMYPARVPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPLMVMSSLLLIIILALSLAYEWLQKGLDWAE
C10192T                                          TCC>TTC ser>phe
AY255152(China) MNFALILMINTLLALLLMIITFWLPQLNGYMEKSTPYECGFDPMFPARVPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPLMVMSSLLLIIILALSLAYEWLQKGLDWTE
G10197A & A10398G                                  GCC>ACC ala>thr                                                    ACC>GCC thr>ala
AF347000(Mkamba)MNFALILMINTLLALLLMIITFWLPQLNGYMEKSTPYECGFDPMSPTRVPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPLMVMSSLLLIIILALSLAYEWLQKGLDWAE
T10237C & A10398G                                               ATT>ACT ile>thr                                       ACC>GCC thr>ala
AY339579        MNFALILMINTLLALLLMIITFWLPQLNGYMEKSTPYECGFDPMSPARVPFSMKFFLVATTFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPLMVMSSLLLIIILALSLAYEWLQKGLDWAE
G10320A                                                                                     GTT>ATT val>ile
HNsq0167(Japan) MNFALILMINTLLALLLMIITFWLPQLNGYMEKSTPYECGFDPMSPARVPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPLMIMSSLLLIIILALSLAYEWLQKGLDWTE
T10321C                                                                                     GTT>GCT val>ala
AF346968(Biaka) MNFALILMINTLLALLLMIITFWLPQLNGYMEKSTPYECGFDPMSPARVPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPLMAMSSLLLIIILALSLAYEWLQKGLDWTE
A10344C                                                                                             ATC>CTC ile>leu 
DQ112947(Eur)   MNFALILMINTLLALLLMIITFWLPQLNGYMEKSTPYECGFDPMSPARVPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPLMVMSSLLLILILALSLAYEWLQKGLDWTE
T10345C & A10398G & C10400T                                                                         ATC>ACC ile>thr   ACC>GCT thr>ala
AY255173(China) MNFALILMINTLLALLLMIITFWLPQLNGYMEKSTPYECGFDPMSPARVPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPLMVMSSLLLITILALSLAYEWLQKGLDWAE
G10365A & T10321 A10398G                                                                   GTT>GCT val>ala GCC>ACC ala>thr ACC>GCC thr>ala
mtdna207(Afr.)  MNFALILMINTLLALLLMIITFWLPQLNGYMEKSTPYECGFDPMSPARVPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWALQTTNLPLMAMSSLLLIIILALSLTYEWLQKGLDWAE

Amino acid table:
A .. ala    M .. met	
C .. cys    N .. asn
D .. asp    P .. pro
E .. glu    Q .. gln
F .. phe    R .. arg
G .. gly    S .. ser
H .. his    T .. thr
I .. ile    V .. val
K .. lys    W .. trp
L .. leu    Y .. tyr

Amino acid sequences are taken from NCBI. Note: In some instances I should be M.


Continued on Page 8

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2005