'tRNA-lys' mutations and comparisons

The transfer RNA for lysine is one of the transfer RNA's of 'mitochondrial DNA'.
It is located at Bases 8295 - 8364.

                 8295            8308                  8321                      8343
Homo sapiens     CACTGTA AA GCTA ACT      TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
Pan paniscus     cactgta aa gcta acc      tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag gaccaacac ctctt tacagtg a
Pan troglodytes  cactgta aa gcta acc      tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag gaccgacac ctctt tacagtg a
Gorilla gorilla  cactgta aa gcta acc      tagc g ttaac cttttaa gttaa agatt aagag tatcggcac ctctt tgcagtg a
Pongo pygmaeus   cattgca aa gcta acc      tagc a ttaac cttttaa gttaa agact aagag aaccagcct ctctt tgcaatg a
Pongo abelii     cactgca aa gcta atc      tagc a ttaac cttttaa gttaa agact aagag aatcaaccc ctctt tgcagtg a
Hylobates lar    cactgta ga gcta aat      tagc a ttaac cttttaa gttaa agact aagag gaccactac ctctt tacagtg a
Macaca Sylvanus  cactgta ca gcta tcc      tagc a ttaac cttttaa gttaa agacg ggggc aaagacaca ccctc tgcagtg g
Macaca Mulatta   cactgta ta gcta tct      tagc a ttaac cttttaa gttaa agacg gggga caca      ccccc tacagtg a
Papio hamadryas  cactgta ca gcta ttc      cagc a ttaac cttttaa gttaa agatt gaggg catg      ctctc tgcagtg a
Cercopithicus    cgctgca ta gcta ttc      tagc g ttaac cttttaa gttaa aaatt gaggg gaata     ccctc tgcagcg a
Colobus Guereza  cgctgta ca gcta tta      tagc a ttaac cttttaa gttaa agatc gagaa acccttc   ttctc tacagcg a
Trachypithecus   cactgta ta gcta cta      tagc a ttaac cttttaa gttaa agacg aggat acact     ttctc tgcagtg a
Cebus albifrons  cactgta aa gcta ct       tagc a ttaac cttttaa gttaa agaca gagag aat       ctctc tacagtg a
Nycticebus       cactgtg aa gcta at       aagc g ttaac cttttaa gttaa agatt gaaag ttataagaa ctgtc cacagtg a
Lemur Catta      cactacg aa gcta at       tagc a ttaac cttttaa gttaa agact gaaag ctcaaac   ctttc cgcagtg a
Tarsius          cactgcg aa gctt ata      tagc a ttaac cttttaa gttaa agacc gaaag tactaat   ctttc cacagtg a
Tupaia           cactatg aa gcta g        tagc g ctaac cttttaa gttag agata aggga ctccaca   acccc catagtg a
Cynocephalus     catcgtg aa gctg aa       cagc a ttaac cttttaa gttaa agaat ggaag tactaac   cttcc cacaatg a

Sciurus vulgaris cattatg aa gcta aca      tagc a ttaac cttttaa gttaa agact aggag tttaaac   ctcct cataatg a   KU962990

rhino
Black rhino (14) cattaag aa gcta ca       tagc a tcagc cttttaa gctga aaatt gagag tctaaat   ccctc cttaatg g :t:
White rhino  (Y) cattaag aa gcta ta       tagc g ttagc cttttaa gttga agatt gagag cccaaat   ctctc cttaatg a :t:
India rhino  (X) cattaag aa gcta ca       cagc g tcaac cttttaa gttga agacc gagag cccaaat   ctctc cttaatg a :t:
Javan rhino (15) cattgag aa gcta ta       cagc g tcagc cttttaa gttga agact gagag tccaaat   ctctc cttaatg g :t:
Woolly rhino(13) cattaag aa gcta ca       cagc a ccaat cttttaa attgg agatt gagag cccagat   ctctc cttagtg a :t:
Sumatran rh.(16) cattaag aa gcta ta       tagc a ccaat cttttaa attgg agact gagag cccagat   ctctc cttagtg a :t:
Tapirus          cattaag aa gcta ta       tagc a ttaac cttttaa gttaa agact gaggg tctaagt   ccctc cttaatg a :t:
Hippopotamus     cattaag aa gcta g        tagc g ctaac cttttaa gttag agact gagag ccaag     ctctc cttaatg a :c:
Equus            cactaag aa gcta tta      tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt gaggg ttcaacc   ccctc cctagtg a :t:
Tuatara (1st)    aaccgag aa gcta atg      cagc a ccagc cttttag c..gg agaca ggaac acat      tctct cttcgtt g   AF534390
Tuatara (2nd)    aaccgag aa gcta atg      cagc a ccagc cttttaa gctgg agaca ggaac acatt     gttcc cttcgtt a   AF534390


Parker's turtle  actacag aa gcta atagagga cagc a ttagc cttttaa gctaa gaaag agacc aacc      cacct ccttagt g   KY705232
Shangri-La Snake cactgag aa gctt tta      cagc a tcagc cttttaa gttga agaag aaaca c         aattt ccttagt g   MF066951
...............

Human NUMT sequences:-
NT_004350.18|Hs1_4507   chromosome  1      47476-47545
                CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
NT_019273.18|Hs1_19429  chromosome  1    3253959-3253899
                CACTGCA AA GCCA TC. CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGGG GATCTGCAC TTCTC
NT_005403.16|Hs2_5560   chromosome  2   53689677-53689745
                CACTGTA AA GCTA TC. TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATG GAGGG GATCTGCAC CTATT TGCAGTG A
NT_005403.16|Hs2_5560   chromosome  2   52624451-52624473
                                      GC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGA
NT_022135.15|Hs2_22291  chromosome  2    9676329-9676397
                CCCTGCT AG GCCC TG  AATA A TTAAC CTTTGAA GTTAA AGACT GAAGG GATCTATAC CCCTC TGCAGTG A
NT_022135.15|Hs2_22291  chromosome  2   32566332-32566264
                CACTGTA AA GTTA TC. CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAT GATCTACAC CTCTC TACAGTG A
NT_022135.15|Hs2_22291  chromosome  2  19741774-19741843
                CACTGTA AA ATTA CCC CAGT G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATC GAGAG AAATCATAC CTCTC TAGAGTG A
NT_022135.15|Hs2_22291  chromosome  2  20847307-20847240
                CACTGTA .. GTTA CCC CAGT G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATC GAGAG AAATCATAC CTCTC TAGAGTG A
NT_022184.14|Hs2_22340  chromosome  2   66867953-66868003
                                       C A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
NT_022459.14|Hs3_22615  chromosome  3   23343878-23343810
                AACTGTA AA GCTA CC. AAGC A TTAAC CTTTTAA GTTGA AGACT GAGGT GATCTATAC CTCTC TGCAGTG A
NT_016354.18|Hs4_16510  chromosome  4   80928165-80928097
                CACTGTA AA ACTA TC. TAGC A TTAAA CTTTTAA GTTAA AGACT GAGCG GATCTACAC CTCTC TGCAGTG A  
NT_034772.5|Hs5_34934   chromosome  5    1803546-1803477 
                CACTGTA AA GTTA ACC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAG AATCACTAC CTCTT TACAGTG A
NT_025741.14|Hs6_25897  chromosome  6   58091961-58092028 
                CACTGTA AA GCTA A.T TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGGA TTCTAAAC  TCCCC TGCAGTA A
NT_007758.11|Hs7_7915   chromosome  7    6829024-6828984
                CACTGTA AA GCTA ATC TAGC A CCAAC CTTTTAA GTTAA AGA
NT_007758.11|Hs7_7915   chromosome  7    1601025-1600955
                CACTGTA AA GCTA CCC CAGC G TTAAC CTTTTAA AGACT TCTTCT GACAG AAATCACAC CTCTC TACAGTG A
NT_023629.12|Hs7_23785 233200-233269       chromosome  7
                AAAAAAA AA GCTA CCC CAGT G TTAAC CTTTTCA GTTAA AGGCT GAGAG AAATCACAC CTCTC TACAGTG A
NT_023629.12|Hs7_23785  chromosome  7    256461-256530
                CACTGTA AA GCTA CCC CAGC G TTAAC CTTTTCA GTTAA AGACT GAGAG AAATCACAC CTCTC TACAGTG A
NT_008046.15|Hs8_8203:56714060-56714108   Homo sapiens chromosome 8
                        AG GCTA A.C TAGC A TTAAC CTTTTAA ATTAA AGACT GAGGT TAGGCACAG
NT_008413.17|Hs9_8570:5089335-5089403     Homo sapiens chromosome 9
                CACTGTA AA GCTA TT. CAGC A TTTAC CTTTTAA GTTAA AGATT GACGG AGTCTACAC CTCTC TGCAGTG A
NT_008583.16|Hs10_8740  chromosome 10   19901487-19901443
                CACTGTA AA GCTA A.T TAGC A TTAAC CTTTAAA GTTAA AAACT GAG
NT_030059.12|Hs10_30314 chromosome 10   20566184-20566115
                CACTGTA AA GCTA ACC CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT AAGAG AATCATTAT CTCTT TACAGTG A
NT_033899.7|Hs11_34054  chromosome 11    6836634-6836567
                CACTGTA AA GCTA .CT TAGC T TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGGG G.TCTACAC CTCTC TGCAGTG A  
NT_024524.13|Hs13_24680 chromosome 13   38758970-38759034
                CGATGTG AA GCTA AC. TAGC A TTAAC CTTTTAA TTTAA AGACT GAGAG .CCAAAAAC CTCTC CCCAGTG A
NT_024862.13|Hs17_25018 chromosome 17  345944-346013    
                CACTGTA GA GCTG ACC CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT AAGAG AATCGCTAT CTCTT TACAGTG A
NC_000022    chromosome 22 chr22:36173964-36174030
                CACTGTG AA GCTA A.T TAGC A TTAAC CTTTTAT GTTAA AGA.. CCGAG AGCCAGGAT TTCTC CACATTA A
NT_011651.16|HsX_11808  chromosome  X   10404775-10404707
                CACTGTA AA GCTA .CC CAGC A TTCAC CTCTTAA GTTAA AGACT GAGGG GATCTTCAC CTCTC TACAGTG A
NT_011651.16|HsX_11808  chromosome  X   25349415-25349446
                                AAA TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GA


...................
COX2
CRS             atg gca cat gca gcg caa gta ggt cta caa gac gct act tcc cct atc ata gaa gag ctt atc acc ttt cat gat cac gcc ctc ata atc att ttc ctt atc tgc ttc cta gtc ctg tat gcc ctt ttc cta aca ctc aca aca aaa cta act aat act aac atc tca gac gct cag gaa ata gaa acc gtc tga act atc ctg ccc gcc      atc atc cta gtc ctc atc gcc ctc cca tcc cta cgc atc ctt   tac ata aca gac gag gtc aac gat ccc tcc ctt acc atc aaa tca att ggc cac            caa tgg tac tga acc tac gag tac acc gac tac ggc gga cta atc ttc aac tcc tac ata ctt ccc cca tta ttc cta gaa cca ggc gac ctg cga ctc ctt gac gtt gac aat cga gta gta ctc ccg att gaa gcc ccc att cgt ata ata att aca tca caa gac gtc ttg cac tca tga gct gtc ccc aca tta ggc tta aaa aca gat gca att ccc gga cgt cta          aac caa acc        act ttc acc gct aca      cga ccg ggg gta tac tac ggt caa tgc tct gaa atc tgt gga gca aac cac agt ttc atg ccc atc gtc cta gaa tta att ccc cta aaa atc ttt gaa ata   gggcccgtatttaccctatagcaccccctctaccccctctagagcc
.......
Human       5   (GRCh38/hg38)chr5:100052855-100053539     {(GRCh37/hg19)chr5:99388559-99389243}  HSA_NumtS_222 chr5:99381642-99390749  mtDNA 6117-15183
                ATG GCA CAT GCA GCA CAA GTA GGT CTA CAA GAC GCT ACT TCT CCT ATC ATA GAA GAA CTA ATC ATC TTT CAT GAT CAT GCC CTC ATA ATC ATT TTT CTC ATC TGC TTT CTA GTC CTG TAC GCC CTT TTC CTA ACA CTC ACA ACA AAA CTA ACT AAT ACT AGT ATC TCA GAC GTC CAA GAG ATA GAA ACC GTC TGA ACG ATC CTA CCC ACT      ATT ATC CTA GTC CTA ATC GCC CTC CCA TCC CTA CGT ATC CTC   TAC ATA ACA GAT GAG ATC AAC GAC CCC TCC TTT ACT ATC AAA TCA ATT GGA CAT            CAA TGG TAT TGA ACC TAT GAA TAC ACT GAC TAT GGT GGA CTA ATC TTC AAC TCC TAT ATA CTC CCC CCA TTA TTC CTA GAA CCA GGT GAC CTA CGA CTC CTT GAC GTT GAT AAC CGG GTG GTC CTC CCA GTT GAG GCC CCC GTC CGT ATA ATA ATT ACA TCA CAG GAT GTC TTA CAC TCA TGA GCT GTC CCC ACA CTG GGC CTA AAA ACA GAT GCA ATT CCC GGA CGC CTG          AAC CAA ACC        ACA TTC ACC GCT ACA      CGA CCA GGG GTA TAC TAC GGC CAA TGC TCA GAA ATC TGT GGA GCA AAC CAC AGT TTT ATG CCC ATC GTC CTA GAA TTA ATT CCC CTA AAA ATC TTT GAA ATA GGA CCC ATA T   TCACCCTATAAC  
.......
Chimp       5   full numt appears to be chr5:99801080-99807880 (with gaps)
                ATG GCA CAT GCA GCA CAA GTA GGT CTA CAA GAt GCT ACT TCT CCT cTC ATA GAA GAA CTA ATC ATC TTT CAT GAT CAT GCC CTC ATA ATC ATT TTT CTC ATC TGC TTT CTA GTC CTG TAC GCC CTT TTC CTA ACA CTC ACA ACA AAA CTA ACT AAT ACT AGT ATC TCA GAt GcC CAA GAG ATA GAA ACC GT. TGA ACG ATC CTA CCC gCT      ATT ATC CTA GTC CTA ATC GCC CTC CCA TCC CTA CGT ATC CTC   TAC ATA ACA GAc GAG ATC AAg GAC CCC TCC TTT ACT ATC AAA TCA ATT GGA CAT            CAA TGG TAT TGA ACC TAc GAA TAC ACc GAC TAT GGT GGA CTA ATC TTC AAC TCC TAT ATA CTC CCC CCA TTA TTC CTA GAA CCA GGT GAC CTA CGA CTC CTT GAC GTT GAT AAC CGG GTG GTC CTC CCA GTT GAa GCC CCC GTC CGT ATA ATA ATT ACA TCA CAG GAT GTC TTA CAC TCA TGA GCT GTC CCC ACA CTG GGC CTA AAA ACA GAT GCA ATT CCC GGA CGC CTG          AAC CAA ACC        ACA TTC ACC GCT ACA      CGA CCA GGG GTA TAC TAt GGC CAA TGC TCA GAA ATC TGT GGA GCA AAC CAC AGT TTT gTG CCC ATC GTC CTA GAA TTA ATT CCC CTA AAA ATC TTT GAA ATA GcA CCC gTA T   TCACCCTATAACacacctttcacccctctccagagcc

.......
Human      17   (GRCh38/hg38)chr17:22028319-22029025     {(GRCh37/hg19)chr17:22028319-22029025} 
                ATG GCA CAC GCA GCC CAG CTA GGT CTT CAA GAC GCC ACA TCC CCT ATC ATA GAA GAG CTA ATC GCC TTC CAT GAT CAC GCC CTC ATA ATC ATC TTT CTT ATC AGC TTT CTA GTT TTA TAC GCC CTC TTC CTA ACA ATT ACA ACA AAA CTA AC- --- ACT AAC ATC ACA GAC GCC CAA GAA ATA GAA ACT GTT TGA ATG ATT CTA CCT GCC      ATT ATC CTA GTC CTA ATT GCC CTT CCA TCC CTA CGT ATC CTG   TAC GTA ACA GAT GAA ATC AAT GAC CCT TCT TTT ACC ATT AAA TCA ATC GGA CAC            CAA TGA TAC TGA ACC TAT GAA TAC ACC AAT TAT GGA GGA TTA ATT TTC AAC TCT TAT ATA CTT CCA CCA CTA TTC TTA GAC CCA AGT GAC CTT CGA CTT CTT AAA GTT GAT AAT CGA GTA GTC CTT CCA ATT GAA GCC CCT GTT CAT ATA ATA ATT ACA TCA CAA GAC GTC CTA CAC TCA TGA ACT GTC CCC ACA TTA GGC TTA AAA ACA GAT GTA ATC CCC GGA CGC CTA          AAC CAA ACC        ACA TTC ACC GCC ATA      CGA CCA GGA GTA TAC TAC GGT CAA TGC TCA GAA ATC TGC GGA GCT GAC CAT AGC TTC ATA ACC ATC ATT CTA GAA CTA ATC CCG CTA AAA ATC TTT GCA ATA GGA CCT GTA T   ccactttataggctaccgcccactctcttaataaggtt
Chimp      17   chr17:33918606-33919202
                ATG GCA CAC GCA GCC CAG CTA GGT CTT CAA GAC GCC ACA TCC CCT ATC ATA GAA GAG CTA ATC GCC TTC CAT GAT CgC GCC CTC ATA ATC ATC TTT CTT ATC AGC TTT CTA GTT TTA TAg GCC CTC TTC CTA ACA ATT ACA ACA AAA CTA AC- --- ACT AAC ATC ACA GAC GCC CAA GAA ATA GAA ACT GTT TGA ATG ATT CTAccCCTGCC      ATT ATC CTA GTC CTA ATT GCC CTT CCA TCC CTA CGT ATC CTG   TAC aTA ACA GAT GAA ATC AAT GAC CCT TCT TTT ACC ATT AAA TCA ATC aGA CAC            CAA TGA cAC TGA ACC TAT GAA TAC ACC gAT TgT GGA GGA TTA ATT TTC AAC TCc TAT ATA CTT CCA CCA CTA TTC TTA GAC CtA gGT GAC tTT CGA CTT CTT AAA GTT GAT AAT CGA GTA GTC CTT CCA ATT GAA GCC CCT GTT CAT ATA ATA ATT ACA TCA CAA GAC GTC CTA CAC TCA TGA ACT GTC CCC ACA TTA GGC TTA AAA ACA GAT GTA ATC CCC gGGACGC CTA          AAC CAA ACC        ACA TTC ACC GCC ATA      CGA CCA GGgAGTA TAC TACGGgT CAA TGgCTCA GAA A
Orangutan  17   chr17:21020585-21021291
                ATG GCA CAC GCA GCC CAG CTA GGT CTT CAA GAC GCC ACA TCC CCT ATC ATA GAA GAG CTA ATC GCC TTC CAT GAT CAC GCC CTC gTA ATC ATC TTT CTT ATC AGC TTT CTA GTT TTA TAt GCC CTC TTC CTA ACA ATT ACA ACA AAA CTA AC- --- ACT AAC ATC ACA GAC GCC CAA GAA ATA GAA ACc cTT TGA ATG ATT CTA CCc GCC      ATT ATC CTA GTt CTA ATT GCC CTT CCA TCC tTA CGT ATC CTG   TAC aTA ACA GAT GAA ATC AAT GAC CCT TCT TTT ACC ATT AAA TCA ATC aGA CAC            CAA TGA TAC TGA ACC TAT GAA TAC ACC gAT TAT GGA GGA TTA ATT TTC AAC TCc TAT ATA CTT CCA CCA CTA TTC TTA GAC CCA gGT GAC CTT CGA CTT CTT gAA GTg GAT AAT CGA GTA GTC tTT CCA ATT GAA GCC CCT GTT CAT ATA ATA ATT AtA TCA CAA GAt GTC tTA CAC TCA TGA ACT GTC CCC ACA TTA GGC TTA AAA ACA GAT GTA ATC tCC GGA CcC CTA          AAC CAA ACC        ACA TTC ACC GCC ATA      CGA CCA GGA GTA TAC TAC GGT CAA TGC TCA GAA ATC TGC GGA GCT aAC CAT AGt TTC ATA cCC ATC gTT CTA GAA CTA ATC CCG CTA AAA ATC TTc GaA ATA GGA CCT GTA T   CCACTTTATAGGCTACCGCCCACTCTCTTAATAAGGTT
Gibbon     17   chr17:50747315-50748000
                atg gcc cat cca gtt caa tTA GGT CTT CAA GAC GCt tCA TCC CCT Act ATA GAA GAa CTA cTt aCC TTC CAT GAc cac act ctt ata att att ttc cta att agt ttc ttg gtt cta tac att att tct cta aTA CAA CAA AAC Tga ttc at- --- act agc act ata gat gtc caa gaa ata aag act gtc tca act atc ttg cct gcc      atc atc ... ... tTA ATT GCC CTc CCA TCg cTA tGT ATC CTG   TAC ATA ACA GAT GAA ATC AAT aAt CCT TCT cTc ACC ATT AAA aCA ATt gGA Cgt            CAA TGg TAt TGA AgC TAc GAg TAt Ata GAT TAT GaA GaA TTA Agc TTC AAt TCt TAT ATA tTT CCA aCA gcc aaC TTA aAa CCA Gaa GAa tTT CaA CTc CTc GAA tTc GAT AAc CaA acA aTC cTc tCA ATa GAA att CCc aTc Cgc Acg tTA ATc tcA TCc aAA GAT GTC cTg CAC TCA TGc ACT aTt CCC cCA TTA GGg TTA AAA ACA GAT GcA ATC cCt GGA CaC tTA          AAC CAA ttt        gCc TTa ACC aCt AcA      CGA CCA GGc cTc TAC TAt Gca CAA TGC TCA GAA ATg tgt gga tct aac cac agt ttt aca tct att gtt tta gaa tta gtc cca tta aaa att ttc aaa act tgg tct ata t   ccacactataatct
.......
Human      10   ATG GCT CAT CCA TTT CAA CTA GGT CTC CAA GAT GCT ACA TCT CCT ATT ATA GAA GAA CTA CTC CAT TTT CAT GAT CAC ACT CTC ATA ATC ATT TTC CTG ATC AGC TCC CTA GTT CTC TAT ATT ATT TCC CTC ATA TTA ACA ACA AAA CTA ATG CAT ACT AGC ACT ACA GAT GCC CAA GAA GTA GAA ACT GTA TGA GCT ACC TTA CCC GCT      ATT ATC CTA ATC TTA ATC GCC CTC CCA TCT gTA TGC ATC CTA   TAT ATG ATG GAT GAA GTG AAT AAC CCC .CT CTC ACT GTC AAA gCC ATA GGA CAT            CAA TGA TAC TGA AGT TAT GAG tAC ACA GAT TAC AAA GGC TTA AGC TTT GAT AAC TAC cTG ATC CCT AtG ACA GAC CTA AAA CCA GGG GAA CTA CGA CTC CTT GAA GTT GGT AAT TGA GTA GTT CTC CCA GTA GAA ATC CCC ATT TGC ATA CTA ATT TCA TCA GAA GAT ATT CTA CAC TCA TGA GCT GTC CCA TCA TTG GGT CTC AAA ACA AAT GCA GTC CCT AGG CAa TTA          AAT CAA GCA        ACC TTA ACA TCC ACA      TGA TCA GGa CTT TAC TAC GGC CAG TGC TCA GaA ATC TGC AGA TCC AAC CAC AGC TTC ATA TCC ATT GTT CTT GAA TTA GTT CCC CTA AAA TAC TTT GAA AGC TGA TCA GCA T   CTATACTATAATAT
Chimp      10   ATG GCT CAT CCA TTT CAA CTA GGT CTC CAA GAT GCT ACA TCT CCT ATT ATA GAA GAA CTA CTC CAT TTT CAT GAT CAC ACT CTC ATA ATC ATT TTC CTG ATC AGC TCC CTA GTT CTC TAT ATT ATT TCC CTC ATA TTA ACA AtA AAA CTA ATG CAT ACT AGC ACT ACA GAT GCC CAA GAA GTA GAA ACT GTA TGA GCT ACC TTA CCC GCT      ATT ATC CTA ATC TgA ATC GCC CTC CCA TCT CTA TGC ATC CTA   TgT ATG ATG GAT GAA GTG AAT AAC CCC .CT CTC ACT GTC AAA ACC ATA GGA CAT            CAA TGA TAC TGA AGT TAT GAG tAC ACA GAT TAC AAA GGC TTA AGC TTT GAT AAC TAC ATG ATC CCT ACG ACA GAC CTA AAA CCA GGG GAA CTA CGA CTC CTT GAA GTT GGT AAT TGA GTA GTT CTC CCA GTA GAA ATC tCC ATT TGC ATA CTA ATT TCA TCA GAA GAT ATT CTA CAC TCA TGA GCT GTC CCA TCA TTG GGT CTC AAA ACA AAT GCA GTC CCT AGG CAC TTA          AAT CAA GCA        ACC TTA ACA TCC ACA      TGA TCA GGt CTT TAC TAt GGC CAG TGC TCA GaA ATC TGC AGA TCC AAC CAC AGC cTC ATA TCC ATT GTT CTT GAA TTA GTT CCC CTA AAA TAC TTT GAA AGC cGA TCA GCA T   CTATACTATAATAT
Gorilla    10   ATG GCT CAT CCA TTT CAA CTA GGT CTC CAA GAT GCT ACA TCT CCT ATT ATA GAA GAA CTA CTC CAT TTT CAT GAT CAC ACT CTC ATA ATC ATT TTC CTG ATC AGC TCC CTA GTT CTC TAT ATT ATT TCC CTC ATA TTA ACA ACA AAA CTA ATG CAT ACT AGC ACT ACA GAT GCC CAA GAA GTA GAA ACT GTA TGA GCT ACC TTA CCC GCT      ATT ATC CTA ATC TTA ATC GCC CTC CCA TCT CTA TGC ATC CTA   TAT ATG ATG GAT GAA GTG AAT AAC CCC .CT CTC ACT GTC AAA ACC ATA GGA CAT            CAA TGA TAC TGA AGT TAT GAG CAC ACA GAT TAC AAA GGC TTA AGC TTT GAT AAC TAC ATG ATC CCT ACG ACA GAC CTA AAA CCA GGG GAA CTA CGA CTC CTT GAA GTT GGT AAT TGA GTA GTT CTC CCA GTA GAA ATC CCC ATT TGC ATA CTA ATT TCA TCA GAA GAT ATT CTA CAC TCA TGA GCT GTC CCA TCA TTG GGT CTC AAA ACA AAT GCA GTC CCT AGG CAC TTA          AAT CAA GCA        ACC TTA ACA TCC ACA      TGA TCA GGC CTT TAC TAC GGC CAG TGC TCA GGA ATC TGC AGA TCC AAC CAC AGC TTC ATA TCC ATT GTT CTT GAA TTA GTT CCC CTA AAA TAC TTT GAA Agc tga tca gca t   ctatactataatat
Baboon      9   ATG GCT CAT CCA TTT CAA CTA GGT CTC CAA GAT ACT ACA TCT CCT GTT ATA GAG GAA CTA CTC CAT TTT TAT GAC CAC ACT CTC ATA ATC ATT TTC CTC ATC AGC TCC CTA GTT CTC TAT ATT ATT TCT CTC TTA TTA ACA ACA AAA CTA ATG CAT ACT AGC ACC GTA GAT GCC CAA GAA GTA GAA ACT GTA TGA GCT ACC TTA CCC GCT      ATT ATC CTA ATC TTA ATC GCC CTC CCA TCT CTA CGC ATC CTT   TAT ATG ATG GAT GAA ATC AAT AAC CCC TCT CTC ACT GTC AAA ACT ATA GGA TAT            CAA TGA TAC TGA AGT TAT GAA TAC ACA GAT TAC AAA GGC TTA AGC TTT GCT AAC TAT ATG ATC CCT ACA ACA GAC CTA AAA CCA GG. GAA CTA CAG CTC CTT GAA GTT GAT AAT TGA GTA GTT CTC CCA GTA GAA ATC CCC ATT CGC ATA CTA ATT TCA TCA GAA GAT GTT CTA CAC TTA TGA GCT GTC CCA TTA TTG GGT CTC AAA ACA GAT GCA GTC CCT AGG CAC TTA          AAT CAA GCA        ACC TTA ACA TCC ACA      TGA CTA GGC CTT TAC TAC AGC CAG TCC TCA GAA ATC TGC AGG TCC AAC CAC AGC TTC ATA TCC GTT GTT CTC GAA TTA GTT CCC CTA AAA TAT TTC AAA AGC TGA TCA GCA T   CTATACTATAATAT
Baboon      4   ATG GCT CAT CCA TTT CAA TTA GGT CTT CAA GAT GCT ATA TCT CCT ATT ATA GAA GAA TTA CTT AAT TTT CAA GAC CAC ACT CTT ATA ATT GTT TTC CTA ATT AGT TCT CTG GTT CTC TAT ATT ... TCC CTC ATA CTG ACA ACA AAA TTA ACA CAC ACT AGC ACT ACA GAT GCC CAT GAA GTT GAA ACT ATA TGG AAG ATC TTA CCC GCT      GTT ATC CTA ATT TTA ATT GCC TTC CCA TCT CAA TGT ATC CTA   TAT ATG ATTAGAT GAA ATT AAT AAC CCT TCT CTC ACT GTC AAA ACA ATT GGC CAT            CAG TGA TAT TGA ATT TAT GAA TAT ACA GAT TAT GAG GAC TTA GGC TTC GAG TCT TAC ATA ATC CCT ACA ACA GCC TTA AAA CC. GGA GAA TTA CGA CTC TTC AAA TTT GAC AGT GGA GTA GTT CTC CTA ATA GAA ATT CCT ATT CAT GTA TCA ATC TCA TCC GAA GAT GTT CTA TAC TCA TGA GCC ATC CCA TCA CTG GGC CTC AAA ACA GAT GCA ATC CCC AGG TGC TTA          AAC CAA ACG        ACC TTG ACC GCC ACA      TGG CCA GGC CTT TAC TAA GGC CAA TGC TCA GAA ATC TGT GGA TTC AAC CAC AGC TTT ATA CCC ATT GTT CTA GAA TTA GTC CCC CTA AAA TGC CTT GAA ACC TGA TC 

Human      22   36173372-36173936
                                                                                                                                                TTA ATT CGT TCA TTA GTA CTT TAT ATT ACT TCC CTG ATA CTA ACA AAT TAA CTT GC- --- ACA AG- ACT ATA GAT GCC CAA GAA GTG GAG ACA ATA TGA ACT ATG TTG CTT GCT      AGT ATC TTA ATT TTA ATT GTT CTC CCA TCA TTA TGT GTT CTA A TAC ATA ATA GAT GAA ATT AAT AAT CTC TCC CTT TCT GTC AAA ACT ATA GGG CAT            CAA TGA TAT TGA AGC TAC AAA TAT ACA GAT TAT GAA GAC CTA AGT TTT GAC TCC TAC ATA ATT CCC ACA ACA GAC TTA AAA TCA AGA GAG CTG TGG TTA CTT GAA GTT GAC AGT TGA GTA GTT CTC CCT ATA GAA ATA TTA ATT CAT ATG TTA ATT TCA TCA GAA GAT GTC CTA TAT TTG TGA GCC ATA CCA TCA CAT CAA TAG GCC TAA AAA TCG TTA CAA TCC CAG GGC          ATT TAA ACC AAG CA ACC TTA ACA TCT ATA      CGA CCA GAC CTT TAC TAC AGA CAA TGC CCA GAA ATC TGC AGA TCC AAC CAT GGC TTT ATA CCC ATT GTT CTT GAA CTA GTC CCC CTA AAG CAC TTC GAA aat tgg tca gcc t   ctgtatcataatat 

Human      22                                                                                                                                                                                                                                   gat gcc caa gaa gtg gag aca ata tga act atg ttg ctt gct      agt atc tta att tta att gtt ctc cca tca tta tgt gtt cta a tac ata ata gat gaa att aat aat ctc tcc ctt tct gtc aaa act ata ggg cat            caa tga tat tga agc tac aaa tat aca gat tat gaa gac cta agt ttt gac tcc tac ata att ccc aca aca gac tta aaa tca aga gag ctg tgg tta ctt gaa gtt gac agt tga gta gtt ctc cct ata gaa ata tta att cat atg tta att tca tca gaa gat gtc cta tat ttg tga gcc ata cca tca cat caa tag gcc taa aaa tcg tta caa tcc cag ggc          att taa acc aag ca acc tta aca tct ata      cga cca gac ctt tac tac aga caa tgc cca gaa atc tgc aga tcc aac cat ggc ttt ata ccc att gtt ctt gaa cta gtc ccc cta aag cac ttc gaa aat tgg tca gcc t   ctgtatcataatat 
Chimp      22                                                                                                                                                                                                                                   GAT GCC CAA GAA GTa GAG ACA ATA TGA ACT ATG TTa CTT GCT      AGT ATC ... ... TTA ATT GTT CTC CCA TCA TgA TGT GTT CTA A TAC ATA ATA GAT GAA ATT AAT AAc CTC TCC CTT aCT GTC tAA ACT ATA GGG CAT            CAA TGA TAT TGA AGC TAC AAA TAT ACA GAT TAT GAA GAC CTg AGT TTT GAC TCC TAC ATA ATT CCC ACA ACA GAC TTA AAA TCA AGA GAG CTG TGG TTg CTT GAA GTT GAC AGT TGA GTA GTT CTC CCT ATA GAA ATA TTA ATT CAT ATG TTA ATT TCA TCA GcA GAT GTC CTA TAT TTG TGA GCC ATA CCA TCA t.. ... TAG GCC TAA AAA TCG TTg CAA TCC CAG GGC          ATT TAA ACC AAG CA ACC TTA AtA TCT AcA      CGA CCA GAC CTT TAC TAC AGA CAA TGC CCA GAA ATC TGC AGA TCC AAC CAT GGC TTT ATA CCC ATT GTT CTT GAA CTA GTC CCC CTA AAG CAC TTC GAA AAT TGG TCA GCC T   CTaTATCATAATAT
Gorilla    22                                                                                                                                                                                                                                   GAT GCC CAA GAA GTA GAG ACA ATA TGA ACT ATG TTg CTT GCT      AGT ATC TTA Att tta aTT GTT CTC CCA TCA TtA TGT GTT CTA A TAt ATA ATA GAT GAA ATT AAT AAt CTC TCC CTT tCT aTC aAA ACT ATA GGG CAT            CAA TGA TAT TGA AGC TAC AAA TAT ACA GAT TAT GAA GAC CTa AGT TTT GAC TCC TAC ATA ATT CCC ACA ACA GAC TTA AAA TCA AGA GAG CTG TGG TTa CTT GAA GTT GAC AGT TGA GTA GTT CTC CCT ATA GAA ATA TTA ATT CAT ATG TTA ATT TCA TCA GaA GAT GTC CTA TAT TTG TGA GCC ATA CCA TCA cat caa TAG GCC TAA AAA TtG TTG CAA TCC CgG GGC          ATT TAA ACC AAG CA ACC TTA AcA TCT AtA      CGA CCA GAC CTT TAC TAC AGA CAA TGC CCA GAA ATC TGC AGA TCC AAC CAT GGC TTT ATA CCC ATT GTT CTT GAA CTA GTC CCC CTA AAG CAC TTC GAA AAT TGG TCA GCC T   CTATATCATAATAT
Orangutan  22                                                                                                                                                                                                                                   GAT GCC CAA GAA GTA GAG ACA ATA TGA ACT ATG TTa CTT GCT      AGT ATC ... ... TTA ATT GTT CTC CCA TCA TgA TGT GTT CTA A TAc ATA ATA GAT GAA ATT AAT AAc CTC TCC CTT aCT gTC AAA ACT ATA GGG CAT            CAA TGA TAT TGA AGC TAC AAA TAT ACA GAT TAT GAA GAC CTg AGT TTT GAC gCC TAC ATA ATT CCC ACA ACA GAC TTA AAA TCA AGA GAG CTG TGG cTA CTT GAA GTT GAC AGT TGA GTA GTT CTC CCT ATA GAA ATA TTA ATT CAc ATG TTA ATT TCA TCA GAA GAT GTC CTA TAT TcG TGA GCC ATA CCA TCA t.. ... TAG GCC TAA AAA TcG TTG CgA TCC CaG aGC          ATT TAA ACC AAG CA ACC TTA ACA TCT AcA      CGA CCA GAC CTT TAC TAC AGA CAA TGC CCA GAA AcC TGC AGA TCC AAC CAT GGC TTT ATA CCC ATT GTT CTT GAA CTA GTa CCC CTA AAG CAC TTC GAA AAc TGG TtA GCC T   CTATATCgTAATAT
Gibbon     22a  ATG GCT CAT CCA gTT CAA TTA GGc CTT CAA GAT GCc AcA TCc CCT ATT ATA GAA GAA cTA CTc AcT TTc CAT GAC CAt gCT CTT ATA ATT aTT TTC CTA ATt AGT TCc ctg gtc cta gac atc att tcc cta ata ctc aca aca aaa tta act cat act ggc acc ata gat gct caa gaa atc gaa act gtg tga act att tta ccc gcc      att atc tta att tta att ggc ctc cca tcc cta tct att gtg   cac ata gta gac aag gtt aac aat cct tct cct act gtc aaa gca att ggc cac            caa tga tat tga agc tat aAA TAT ACA GAc TAT GAa GAg TTA GGC TTT GAT TCT TAt ATg ATt CCa ACA gCA GAC TTA AAg CCA GGA GAA Cgt CGA CTC CTt gAA GTT GAt AAc tGA acA ATT CTC CCA ATA GAg atc cct gtc cat ata tta atc tca tcc gaa gac atc ctg cat tca tga act atc ccc ttA CTG GGC CTC AAA ACA GAT Gga ATC CCC gGa CGC TTA          AAt CaA AcG        ACC TTa ACC gCt ACA      TGt CCA GGC CTT TAC TAT Gga CAg TGC TCA GAA ATt TGT GGg tCt AAC CAC AGt TTT ATA Ctt att gtc cta gaa tta aCC CCC TtA AaA TGC TTT GAA ACC TGA TCc acg t   ctgcactataatat
Rhesus      8   atg gcc cac cca gtt caa cta agc ctg CAA GAC GCC ACA TCt CCT gTt ATA GAg GAa tTA ATt aCt TTC CAT GAc CAt GCt tTt ATA gcC ATa TcT CTT ATC AGC TTc CTA GTg TTA TAt GCC CTa cTC tcA ACA cTc ACA ACA AAA CTA ACc aat ACT AAC ATC ACA GAC GCC CAA GAA ATA GAA ACT aTc TGA Act ATc tTA CCc GCa      ATT ATC tTA aTC CTA ATT GCt CTc CCA TCt CTA CGc ATC CTa   TAC cTA ACA GAT GAA gTC AAc GAC CCa TCc TTc ACC ATc AAA TCA ATC GGA CAt            CAA TGA TAC TGA ACC TAc GAA TAC ACg gAc TAc GGA GGc cTA ATT TTC AAC TCc TAc ATA CTa CCc CCg CTA TTC cTA aAC CCA gGa GAC CTc CGA CTc CTa gAA GTT GAc AAT CGA GTA GTC CTT CCA ATT GAA GCt CCT GTa CgT ATA ATA ATT ACA TCt CAA GAC GT. ..g CAC TCA cGA ACT aTt CCC ACA cTA GGC cTA AAg ACA GAT Gcg gTa CCt GGA CGC CTA          AAt CAA ACt        gtt ttc atg gcc aca cacA CGA CCA GGc GTc TAt TAC GGa CAA TGC TCA GAg ATC TGt ggt gca aat CAT AGC TTC ATA cCa ATt gTT gcA GAA CTg ATC CCa CTA AAA ATC TTT GaA ATA GGA CCT GTA T                                                                                                                                                                                                                                
Baboon      8   ATG GCT CAT CCA GTT CAA CTA GGC CTA CAA GAT GCC ACA TCC CCT GTC ATA GAG GAA CTA GTT ACT TTT CAC GAC CAT GCC CTT ATA GCT ATA CTT TTA ATT AGC TTT TTA ATC TTA TAC GCC CTA TCC GCA ACA CTC ACA ACA AAA CTA ACC AAC ACT AAT ATC ACG GAC GCC CAA GAA ATA GAA ACC ATC TGA ACC ATT CTA CCC GCG      GTT ATC TTA GTC CTA ATC GCC CTC CCG TCC CTG CGC ATC CTA   TAT ATA ACA GAC GAA ATC AAC AAC CCC TCC TTT ACT ATT AAA TCA ATC GGA CAT            CAA TGA TAC TGA ACC TAC GAG TAC ACA GAT TAC GGG GGC TTA ATC TTC AAC TCT TAT ATA TTA CCC CCA TTG TTC CTA AAC CCG GGC GAC CTT CGA CTT CTA GAA GTT GAC AAT CGA GTA GTC CTC CCA ATT GAA GCT CCA GTC CGT ATA ATA ATC ACA TCC CAA GAC GTA CTA CAC TCA TGA ACT ATC CCC ACA TTA GGC CTA AAA ACA GAC GCA GTA CCC GGA CGC TTG          AAC CAA ACC        GTA TTC ACA GCC ACA      CGA CCA GGC GTC TAT TAT GGT CAA TGC TCA GAA ATT TGC GGC GCA AAC CAC AGC TTC ATA CCA ATC GTC GCA GAA CTA ATT CCA CTA AAA ATT TTT GAA ATA GGA CCT GTA T   TCACCCTGTAACCCC  
Orangutan   8   ATG GCA CAC GGA GCC CAG CTA GGT CTT CAA GAC GCC ACA TCC CCT ATC ATA GAA GAG CTA ATC GCC TTC CAT GAT CAC TCC CTC ATA ATC TTC TTT CTT ATC AGT TTT CTA GTT TTA TAT GCC CTC TTC CTA ACA ATT ACA GCA AAA CTA ACT AAC ACT AAC ATC ACA GAC GCC CAA GAA ATA GAA ACT GTT TGA ACG ATT CTA CCC GCC      ATT GTC CTA GTG TTA ATT GCC CTT CCA TCC CTA CGT ATC CTG   TAC ATA ACA GAT GAA ATC AAT GAC CCT TCT TTT ACC ATT ATA TCA GTC GGA CAC            CAA TGA TAC TGA ACC TAT GAA TAC ACC GAT TAT GGA GGA TTC ATT TTC AGC TCC TAT ATG CTT CCA CCA CTA TTC TTA GAC CCA GGT GAC CTT CGA CTT CTT GAA GTT GTT AAT CGA GTA GTC CTT CCA ATT GGA GCC CCT GTT CAT ATA ATA ATT ACA TCA CAA GAC GTC CTA CAC TCA TGA ACT GTT CCC ACA TTA .GC TTA AAA ACA GAT GGA ATC CCC AGA CGC CTA          AAC CAA ACC        ACA TTC ACC GCC ATA      CGA CCA GGA GTA TAC TAC GGT CA. TGC TCA GAA ATC TGC GGA GCT AAC CAT AGT TTC ATA CCC AT  
Marmoset    8   atg gct cac cct GTT CAg TTA GGC CTT CAA GAT GCT ACA TCC CTt tTT ATA GAA gAA CTc CTC ACT TTC CAt GAC CAT aCT CTT ATA ATg ATT TTC CTA ATT AGT TCC CTa GTC CTg TAt ATT ATT TCC cTA AT. ... ACA ACA AAA TcA gCT CAT ACT AGC ACC AtA gAT Gtc CAA GAA ATt GAG ACT Gag cta TCT TAC CTg CCA ...      .TT ATC TTA ATT tta att gcc ctt cca tCC CTA CGT ATT CTG   TAt ATA ACA TAT GAG gTT AAC AAC CaT TCT CTT Att gTC AAA gCA gTT Gat CAC            CAA aGA cAT TGA AGC TAC GAA TgT ACA GAC TAT GAA GAA TTA GgC TTC aAT TCt TaT aTA GTC CCA ACA GCA gAC TTA AAG ccA cGA GAA CTT cGA CTC CTC GAA GTT GAT AAC CGA ACA ATT CTC CCA ATAaGAG ATC CCC ATC caT ATA TTA ATC TCA TCt GAA GAT GTC CTG cAC TCA TGc ACT ATt CCC TCA tTa GGC CTC AAA ACA GAT GCA ATC agt ccc cagacact taaatca aac tac ctt        gac tgc tac acg a..      ... cca agc ctt tac tac aga cag taC TCA GAA Aag TGT GGG TCT AAC CAC AGT T.. ATc CCT ATT GTC CTA GAA TTA AcC Ccc TTA AAA TaC TTC AAA acc tga tcc aca t   tcacactataatat 
Baboon      5   ATG GCT CAg GCA GTT CAa TcA GGC cTT CAA Gac tCT ACA TCC CCT ATT ATa GAA GAA cTA CTC ACT TTa CAT GAg CAc ACT CTT ATA ATT ATT TTC CTA ATT AGc TCC CTa GTC CTA TAc ATT ATT TCC CTA ATA CTC ACA ACA AAa TTA ATT CAT ACT AgC AcC AaA GAT GCC CAA GAA ATC aAG ACT aTg TGA ACT ATt TtA CCT GCC      ATT ATC TTA ATT TTA ATT GCC CTC CCA TCC CTA tGT ATT CTg   taa ata act ... ... ... aac aac cct tct ctt acc gtc aaa tca att ggc CAC            CAA TaA TAT TGA AGC TAT GAa TgT ACA GAc tgT GAA GAa TTA aGC TTc GAT TCT TAT ATA Att CCA ACA GCA GAC TTA AAG CCA GGA GAa CTT CAA CTC cTc GAA GTT GAT AAC caa aac aat tcc tcc caa cag atatccccatc cat gTA TTA aTC TCA TCC GAA GAt GTC CTg CAC TCA TGA ACT ATc CCC TCA TTg GGC cTg AAA ACA GgT GCA ATc CCT GgA TGC cTA          AAt caa acc        acc cta ACT GCT AtA      cGA CCA GaC CTT TAC TAt GGA CAG TGC TCA gAA ATc TGT GGG TCc AAC CAC aGT gTT ATA CCT ATT GTC CTA GAA TtA Aca CCC TTA AAA tgc TTC aAA ACC TGA TCC ACg t   CCACACTATAAcAT
Human       1a  ATG GCA CAT GCA GCG CAA GTA GGT CTA CAA GAC GCT ACT TCC CCT ATC ATA GAA GAG CTT ATC ATC TTT CAT GAT CAC GCC CTC ATA ATC ATT TTC CTT ATC TGC TTC CTA GTC CTG TAC GCC CTT TTC CTA ACA CTC ACA ACA AAA CTA ACT AAT ACT AAC ATC TCA GAC GCT CAG GAA ATA GAA ACC GTC TGA ACT ATC CTG CCC GCC      ATC ATC CTA GTC CTT ATC GCC CTC CCA TCC CTA CGC ATC CTT   TAC ATA ACA GAC GAG GTC AAC GAT CCC TCC TTT ACC ATC AAA TCA ATT GGC CAT            CAA TGG TAC TGA ACC TAC GAA TAC ACC GAC TAC GGC GGA CTA ATC TTC AAC TCC TAC ATA CTT CCC CCA TTA TTC CTA GAA CCA GGC GAC CTG CGA CTC CTT GAC GTT GAC AAT CGA GTA GTA CTC CCG GTT GAA GCC CCC ATT CGT ATA ATA ATT ACA TCA CAA GAC GTC TTA CAC TCA TGA GCT GTC CCC ACA TTA GGC TTA AAA ACA GAT GCA ATT CCC GGA CGT CTA          AAC CAA ACC        ACT TTC ACT GCT ACA      CGA CCA GGG GTA TAC TAC GGC CAA TGC TCT GAA ATC TGT GGA GCA AAC --C AGT TTT ATG CCC ATC GTC CTA GAA TTA ATT CCC CTA AAA ATC TTT GAA ATA GGG CCC GTA T   TTACCCTATAGCACCCC

Human       1b  ATG GCT GAT CTA GTT CAT TTA GGC CTT CAA GAT GCT ACA TCC C.T ATT ATA GAA .AA CTA CTC ACT TTC CAC GAC CAT GCT CTT ATA ATT ATT TTC CTA ATT AGT TCC CTG GTC CTA TAC ATT ATT TCC TTA ATA CTC ACA ACA AAA TTA ACT CAT ACT AGC ACC AAA CAT GCT CAA GAA ATC GAG ACT GTC TGA ACT GTC TTA CCT TCC      ATT ATC TTA ... ... ATT GCC ACCCCCA CCC CTA CGT ATT CTG   TAC ATA ACA TAT GAG CTT AAC AAC CCT TCT CTT ACC ATC AAA ACA ATT GGC CAC            CAA TGA TAT TGA AGC TAC GAA TAT ACA GAC TAT GAA GAA TTA GAC TTC GAT TCC TTT TTA GTC CCA ACA GCA AAC TTA AAG GTA GGA GAA CTT TGA CTC CTC GAA GTT GAT AAC CGA ACA ATT CTC CCA ATA GAG ATC CCC ATC TGT ATA TTA ATC TCA TCC GAA GAT GTC CTG AAC TCA TGA ACT ATC CCC TCA CTG GGC CTC AAA ACA GAT GCA ATC CCC GGA CTC TTA          AAC ..T ACC        ... TTA ACC GCT ACA      CAA GCA GGC CTT TAT TAT GGA TGG TGC TCA GAA ATT TGT GGG TCT AAC CAC AGT TTT ATA CCT ATT GTC CTA GAA TTA A.T CCT TTT AAA ATG CTT CAA A 
Gibbon      5   agg gca tat cca ttt CAA TTA GGC TTC CAA GAT GCT ATG TCA CCT ATC ACA GA. ..A CTC CTT CAC TTT CAT GAC CAC ACC CTA ATA ATT GTT TTT TTA ATG AGC TCA TTA GTA CTT TAC ATT ATC TCC CTG ATA GTA ACA ACT AAA --- ACT CAC ACA AAC ACA ATG G-- --- --- --- --- --- --- -TA TGA ACT ATT TTA CCT GCT      ATT ATC TTA ATT TTA ATT GCT CTT TCA TCA TTA TGT ATA TTA   TAT ATA ATA GAT GAA ATT ATA AC- CCC TCC CTT ACC ATC AAA ACT ATA GGA CAC            CAA TGA TAC CGA AGC TAT GAA TAC ACA GAT TAT GAA GAC CTA AAG TTT GAT TCC TAT GTA ATT TCT ACA ACA GAC TTA AAA CCA GGA GAA CTG TGG CTA CTT GAA GTT GAT AAT CAA GTA ATC CTC CCC ATA GAA ATA TCA ATT CGC AT- -CA ATT GCA TCA GAA GAT ATT CTA TAT TCA TGA GCT GTG TAC CAT CAT TAGGCCTAAAG CCA GAT GCA ATC CCA GGA CTT TTA          AAC CAA GCA        ACA TTG ACA TCT ACA      CGG CCA GGT CTT TAC CAC CGT CAA TCC CCA GAA ATC TGC ACA TCT AAT CAC AGC TTC ATG CCC ATT GTT CTT GAA CTG GTA CCC CTA AAA TGC TTT GAA AAT TGA GCA ACA T   CTATATTATAATAT  
Chimp       1   ATG GCT GAT CTA GTT CAa TTA GGC CTT CAA GAT GCT ACA TCt CTA TTA TAG AAg .AA CTA CTC ACT TTC CAt GAC CAT GCT CTT ATA ATT ATT TTC CTA ATT AGT TCC CTG GTC CTA TAC ATT ATT TCC TTA ATA CTC ACA ACA AAA TTA ACT CAT ACT AGC ACC AAA CAT GCT CAA GAA ATC GAG ACT GTC TGA ACT GTC TTA CCT gCC      ATT ATC TTA ... ... ATT CcC CCC CAC .CC CTA CGT ATT CTG   TAC ATA ACA TAT GAG CTT AAC AAC CCT TCT CTT ACC ATC AAA ACA AcT GGC CAC            CAA TGA TAT TGA AaC TAC GAA TAT ACA GAt TAT GAA GAA TTA GAC TTC GAT TCt TaT TTA GTC CCA ACA GCA AAC TTA AAG GTA GGA GAA CTT TGA CTC CTC aAA GTT GAT AAC CGA ACA ATT CTC CCA ATA GAG ATC CCC ATC TGT ATA TTA ATC TCA TCC GAA GAT GTC CTG AAC TCA TGA ACT ATC CCC TCA CTG GGC CTC AAA ACA GAT GCA ATC CCC GGA CTC TTA          AAC ..T ACC        ... TTA ACC GCT ACA      CAA GCA GGC CTT TAT TAT GGA TGG TGC TCA GAA ATg TGT GGG TCT AAC CAC AGT TTT ATA CCT ATT GTC CTA GAA TTA A.T CCT TTT AAA ATG CTT CAA Aacttga tcc atg t   ctgatctataatat

Human       2a  ATG GCT TAT CCA GTT CAA TTA GGC CTT CAA GAC ACC ACA TCC CCT ATT ATA GAA GAA CTA CTC ACT TTC CAT GAC CAT GCT CTT ATA ATT ATT TTC CTA ATT AGT TCC CTG GTC CTA GAC ATC ATT TCC CTA ATA CTC ACA ACA AAA TTA ACT CAT ACT GGC ACC ATA GAT GCT CAA GAA ATC GAA ACT GTG TGA ACT GTT TTA CCT GCC      ATT ATC TTA ATT TTA ATT GCC CTC CCA TCC CTA CGT ATT GTG   CAC ATA ATA GAC AAG GTT AAC AAT CCT TCT CTT ACT GTC AAA GCA GTT GGC CAC            CAG TGA TAT TGA AGC TCT AAA TAT ACA GAC TAT GAA GAG TTA GGC TTT GAT TCT TAT ATG ATT CCA ACA GCA GAC TTA AAG CC. ..A GAA CTT CGA CTC CTT GAA GTT GAT AAC TGA ACA ATT CTC CCA ACA GAG ATC CCT GTC CAT ATA TTA ATC TCA TCC GAA GAC ATC CTG CAT TCA TGA ACT ATC CCC TTA CTG GGC CTC AAA ACA GAT GGA ATC CCC GGA CGC TTA          AAT TAA ACT        ACC TTA ACT GCT ACA      TGT CCA GGC CTT TAC TAT GGA CAG TGC TCA GAA ATT TGT GGG TCT AAC CAC AGT TTT ATA CTT ATT GTC CTA GAA TTA ACC CCC TTA AAA TGC TTT GAA ACC TGA TCC ACG T   CTGCACTATAATAT  

Chimp       2B  ATG GCT cAT CCA GTT CAA TTA GGC CTT CAA GAC ACC ACA TCC CCT ATT ATA GAA GAA CTA CTC ACT TTC CAT GAC CAT GCT CTT ATg ATT ATT TTC CTA ATT AGT TCC CTG GTC CTA GAC ATC ATT TCC CTA ATA CTC ACA ACA AAA TTA ACT CAT ACT GGC ACC ATA GAT GCT CAA GAA ATt GAA ACT GTG TGA ACT GTT TTA CCT GCC      ATT ATC TTA ATT TTA ATT GCC CTC CCA TCC CTA CGT ATT cTG   CAC ATA ATA GAC AAG GTT AAC AAT CCT TCT CTT ACT GTC AAA GCA GTT GGC CAC            CAG TGA TAT TGA AGC TCT AAA TAT ACA GAC TAT GAA GAG TTA GGC TTT GAT TCT TAT ATG ATT CCA ACA GCA GAC TTA AAG CC. ..A GAA CTT CGA CTC CTT GAA GTT GAT AAC TGA ACA ATT CTC CCA AtA GAG ATC CCT GTC CAT ATA TTA ATC TCA TCC GAA GAC ATC CTG CAT TCA TGA ACT ATC CCC TTA CTG GGC CTC AAA ACA GAT GGA ATC CCC GGA tGC TTA          AAT TAA ACT        ACC TTA ACT GCT ACA      TGT CCA GGC CTT TAC TAT GGA CAG TGC TCA GAA ATT TGT GGG TCT AAC CAC AGT TTT ATA CTT ATT GTC CTA GAA TTA ACC CCC TTA AAA TGC TTT GAA ACC TGA TCC ACG T   CTGCACTgTAATAT
Gorilla     2B  ATG GCT cAT CCA GTT CAA TTA GGC CTT CAA GAC ACC ACA TCC CCT ATT ATA GAA GAg CTA CTC ACT TTC CAT GAC CAT GCT CTT ATA ATT ATT TTC CTA ATT AGT TCC CTG GTC CTA GAC ATC ATT TCC CTA ATA CTC ACA ACA AAA TTA ACT CAT ACT GGC ACC ATA GAT GCT CAA GAA ATC GAA ACT GTG TGA ACT GTT TTA CCT GCC      ATT ATC TTA ATT TTA ATT GCC CTC CCA TCC CTA tGT ATT cTG   CAC ATA ATA GAC AAG GTT AAC AAT CCT TCT CTT ACT GTC AAA GCA aTT GGC CAC            CAa TGA TAT TGA AGC TCT AAA TAT AtA GAC TAT GAA GAG TTA GGC TTT GAT TCT TAT ATG ATT CCA ACA GCt GAC TTA AAG CC. ..A GAA CTT CGA CTC CTT GAA GTT GAT AAC TGA ACA ATT CTC CCA AtA GtG ATC CCT GTC CAT ATA TTA ATC TCA TCC GAA GAC ATC CTG CAT TCA TGA ACT ATC CCC TTA CTG GGC CTC AAA ACA GAT GaA ATC CCC GGA CGC TTA          AAT TAA ACT        ACC TTA ACc GCT ACA      TGT CCA GGC CTT TAC TAT GGA CAG TGC TCA GAA ATT TGT GGG TCT AAC CAC gGT TTT ATA CTT ATT GTC CTA GAA TTA ACC CCC TTA AAA TGC TTT GAA ACC TGA TCC ACG T   CTGCACTATAATAT
Human       2b  ATG GCC CAT CCA GTT CAA TTA GGT CTT CAA GAT GCT TCA TCT CCT ATT ATA GAA GAA CTA CTT ACC TTC CAT GAC CAC ACC CTT GTC ATT GTT TTC CTA ATT AGT TCC CTG GTT CTA TAC ATT ATT TCT GTA ATA CTC ..A ACA AAA CTG ACC AAC AAT AGC ACC ATA GAT GCC CAA GAA ATA GAG ACT GTC TGA ATT ATC TTG CCT GTT      ATC ATC TTA ATC TTA ACT GCC CTC CCA TCC CTA CGT ATG TTA   TCT ATA ACA GAT GAA GTC AAT AAG CCT TCT CTC ACC GTT AAA ACA ATT GGA CAT            CAA TGG TAT TGA AGC TAC TAG TGT ACA GAT TAT GAA GAG TTA AGC TTC GAT TCT TAT ATG CTT CCA ACA GCA GAC CTA AAA CCA GAA GAA CGT AGA CTC CTT GAA GTC GAT AAC CGA ACA ATC CTC CCA ATA GAA ATT CCC ATC CAC ATG TTA ACC TCA TCT GAA GAT GTC CTG CAC TCA TGA ACT ATT CCC TCA TTA GGT TTA AAA ACA GAT GCA GTC CCT GGA CGC CTA          AAC CAA TTT        ACC TTA ACC ACT ACA      CGA CCA GGC CTC TAC TGC AGA CAA TGC TCA GAA ATC TGT GGA TCT AAT CAC GGT GTT ATA CCT ATT GTT CTA GAA TTA GTT CCA TTA AAA ACT TTT GAA ACT TGA TCT ATA T   CCACACCATAATAT  
Human       2c  ATG GCC CAT ACA GTT CAA TTA GGT CTT CAA GAT GCT TCA TTT GCT ATT ACA GAA TAA CTA CTT ACC TTC CAT GAC CAC ATC CTT GTC ATT GTT TTC CTA ATT AGT TCC CTG GTT CTA TAC GTT ATT TCT CTA ATA CTC ACA ATA AAA TTG ACT AAC AAT AGC ACC ATA GAT GCC CAA GAA ATA GAG ACT GTC TGA ATG ATC TTG CCT GCT      AGC ATC TTA ATC TTA ACT GCC CTC CCA TCC CTA CGT ATG TAA   TAT ACA ACA GAT GAA GTC AAT AAG CCT TCT CTC ACC GTT AAA ACA ATC GGA CAT            CAA TGG TAT TGA AGC TAC TAG TGT ACA GAT TAT GAA GAG TTA AGC TTC TAT TCT TAT ATG CTT CCA ACA GCA GAC CTA AAA CCA AAA GAA CTC CGA CTC CTT GAA GTC GAT AAC CGA ACA ATC CTC CCA ATA GAA ATT CCC ATC CGC ATG TTA ACC TCA TCT GAA GAT GTC CTG CAC TCA TGA ACT ATT CCC TCA TTA GGT TTA AAA ACA GAT GCA GTC CCT GGA CGC TTA          AAC CAA TTT        ACC TTA ACC ACT ACA      CGA CCA GGC TTC AAC TAC AGA CAA TGC TCA GAA ATC TGT GGA TCT AAT CAC GGT TTT ATA CCT ATT GTT CTA GAA CTA GTT CCA TTA AAA ACT TTT GAA ACT TGA TCT ATA G   CCACACGATAATAT  
Human      11   ATG GCT CAT GCA GTT CAG TTA GGC TTT CAA GGT GCT ACA TCC CCT ATT ATG GAA GAA TTA CTC ACT TTC CAT GAC CAT ACT CTT ATA ATT ATT TTC CTA ATT AGT TCC CTG GTC CTA TAT ATT ATT TCC CTA ATA CTC ACA ACA AAT TAA TTC ATA CTA ACA GCA TAG ATG CC. CAA GAA ATC GAG ACT GTC TGA ACT ATC TCA CCT GCC      ATT ATC TTA ATT TTA ATT GCC CTC CCA TCC CTA CGT ATT CT.   ATA ACA GAT GAG GTT CAC AAC CCT TCT ATT ACC ATC AAA ACA ACT ... GGT CAC            CAA TGA TAT TGA AGC TAT GAG TAT ACA GAA CAT GAA GAG TTA GGC TTT GAT TCT TAT ATA ACC CCA ACA GCA GAC TTA AAG CCA GGA GAG CTT CAA CTC TTT GAA GTT GAT AAC TGA ACA GTT CTC CCA ATA GAG ATA CCC ATC TGT ATA TTA GTC TCA TCC GAA GAC GTC CTA CAC TCA TGA ACT ATT CCC TCA TTA GGC ATC AAA ACA GAT GCA ATT CCT GAA TGC TTA          AAC TAC CTT        GAC TGC TAC ATG A..      ... CCA GGC CTT TAC TAC GGA CAG TGC TCA AAA ATG TGT GGG TCT AAC CAC GGT TTT ATA CCT ATT GTC CTA GAA TCA ATT CCC TTA AAA AAT TTC GAA ACC TGA TCC ACA A   CCACACTATAATAT  
Chimp      11   ATG GCT CAT GCA GTT tAG TTA GGC TTT CAA GGT GCT ACA TCC CCT ATT ATG GAA GAA TTA CTC ACT TTC CAT GAC CAT ACT CTT ATA ATT ATT TTC CTA ATT AGT TCC CTG GTC CTA TAT ATT ATT TCt CTA ATA CTC ACA ACA AAT TAg TTC ATA CTA ACA GCA TAG ATG CC. CAA GAA ATC GAG ACT GTC TGA ACT ATC TCA CCT GCC      ATT ATC TTA ATT TTA ATT GCC CTC CCA TCC CTA CGT ATT CT.   ATA ACA GAT GAa GTT CAC AAC CCT TCT ATT ACC ATC AAA ACA ACT ... GGT CAC            CAA TGA TAT TGA AGC TAT GAG TAT ACA GAA CAT GAA GAG TTA GGC TTT GAT TCT TAT ATA ACC CCA ACA GCA GAC TTA AAG CCA GGA GAG CTT tAA CTC TTT GAA GTT GAT AAC TGA ACA GTT CTC CCA ATA GAG ATA CCC ATC TGT ATA TTA GTC TCA TCC aAA GAC GTC CTA CAC TCA TGA ACT AcT CCC TCA TTt GGC ATC AAA ACA GAT GCA ATT CCT GAA TGC TTA          AAC TAC CTT        GAa TGC TAC ATG A..      ... CCA GGC CTT TAC TAC aGA CAG TGC TCA AAA ATG TGT GGG TCT AAC CAC aGT TTT ATA CCT ATT GTC CTA GAA TCA ATT CCC TTA AAA AAT TTC aAA ACC TGA TCC ACA A   CCACACTATAATAT
Gorilla    11   ATG GCT CAT GCA GTT tAG TTA GGt TTT CAA GGT GCT ACA TCC CCT ATT ATG GAA GAA TTA CTC ACT TTC CAT GAC CAT ACT CTT ATA ATT ATT TTC CTA ATT AGT TCC CTG GTC CTt TAT ATT ATT TCC CTA ATA CTC ACA ACA AAT TAA TTC ATA CTA ACA GCA TAG ATG CC. CAA GAA ATC GAG ACT GTC TGA ACT ATC TCA CCT GCC      ATT ATC TTA ATT TTA ATT GCC CTC CCA TCC CTA CGT ATT CT.   ATA ACA GAT GAG GTT CAC AAC CCT TCT ATT ACC ATC AAA ACA ACT ... GGT CAC            CAA TGA TAT TGA AGC TAT GAG TAT ACA GAA CAT GAA GAG TTA GGC TTT GAT TCT TAT ATA ACC CCA ACA GCA GAC TTA AAG CCA GGA GAG CTT tAA CTC TTT GAA GTT GAT AAC TGA ACA GTT CTC CCA AcA GAG ATA CCC ATC TGT ATA TTA GTC TCA TCt GAA GAC GTC CTA CAC TCA TGA ACT ATT CCC TCA TTA GGC ATC AAA ACA GAT GCA ATT CCT GAA TGC TTA          AAC TAC CTT        GAC TGC TAC ATG A..      ... CCA GGC CTT TAC TAC GGA CAG TGC TCA AAA ATG TGT GGG TCT AAC CAC GGT TTT ATA CCT ATT GTC CTA GAA TCA ATT CCC TTA AAA AAT TTC GAA ACC TGA TCC ACA A   CCACACTATAATAT
Orangutan  11   AcG GCT CAT GCA GTT tAG TTA GGC cTT CAA GGT GCT ACA TCC CCT ATT ATG GAA GAA TTA CTC ACT TTC CAT GAC CAT ACT CTT ATA ATT ATT TTC CTA ATT AGT TCC CTG GTC CTA TAT ATT ATT TCC CTA ATA CTC AtA ACA AAT TAA TTC ATA CTA ACA GCA TAG ATG CC. CAA GAA ATC GAG ACT GTC TGA ACT ATC TtA CCT GCC      ATT ATC TTA ATT TTA ATT GCC CTC CCA TCC CTA CGT ATT CT.   ATA ACA GAT GAG GTT CAC AAC CCa TCT ATT ACC ATC AAA ACA AtT ... GGT CAC            CAA TGA TAT TGA AGC TAT GAG TAT ACA GAA CAT GAA aAG TTA GGC TTT GAT TCT TAT ATA ACC CCA ACA GCA GAC TTA AAG CCA aGA GAG tTT CgA CTC cTT GAA GcT GAT AAC TGA ACA GTT CTC CCA ATA GAG gTA CCC ATC TGT ATA TTA GTC TCA TCC GAA GAC GTC CTg CAC TCA TGA ACT ATT CCC TCA TTA GGC ATC AAA ACA GAT GCg ATT CCT GAA TGC TTA          AAC TAC CTT        GAC TGC TAC ATG A..      ... CCA GGC CTT TAC TAa GGA CAG TGC TCA AAA ATt TcT aGG TCT AAC CAC aGT TTT ATA CCT ATT GTC CTA GAA TCA ATT CCC TTA AAA AAT TTC aAA ACt TGA TCC ACA A   CCACACTATAATAT
Gibbon     21   ATG GCT CAT cCA TTT CAA Gta ggc ctt tga gaT GCT ACA TCC CCT ATT ATa GAA GAA cTg CTC ACT TTC CgT GAC CAc gCT CTT ATA ... .TT TTC CTA ATT AGT TCC CTG GTC CTc TcT ATT ATc TCC CTA gTA CTC ACA ACA AAa TTA AcT CATACTA gCA tCA TAG ATG CC. CAA GAA ATC GAG gCT GTC TGA ACT ATC TtA CCT GCC      ATT ATC TTc ATT TTA ATT GCC CTC CCA TCC tTA CaT ATT CTg   tac ATA ACA GAT GAG GTT aAC AAC CCT TCT cTT ACC gTC AAA gCA AAT GAT ATT            GAA GCT ATG Aac ata tag acTGAAGAaT TAGGCTTTGA TTCTTATATA  gtCCCAAgAG CAGACTTAAA GCCAGagaac ttcacctcct cGAAGTTGAT  AACcaAACAa cTCTCCCAgt AGAGATcCCC ATCcGTATgT TAaTCTCATC  TGAAGAtGTC CTgCACTCgT GAACTATCCC Ttcactgggc cTCAAAACAG  ATGCAATcCC TGgacgctta aatcAAACTA CCTTGACTGC TACATGACCA  GGCCTTTAtT AtGGACAGTG CTCAgAAATt TGTGGGTCTc AtCACaGTTT  TATACCTATT GTCCTtGAAT tAATCTTAAA AtAcaTCGAA ACCTGATCCA  tAtCtgCACT ATAATATaac tgca
Marmoset   21   ATG GCT CAT CCA GCT CAA TTA GGC CGT CAA GAC TCA ACA TCC CCT ATT ATA GAA GAA CTG CTC ACT CTC CAT GAC CAC GCT CTT GTA ATT ATT TTC CTA ATC TGT TTC CTA GTC CTA TAT ATT ATC TCC CTA A.A CTC ACA ACA AAA TTA ACT CAT ACT AAC ACC ACA GAT GCC CAA GAA ATC AAG ACT GTC TAT ACT ACT TTA TGT ACC      CTT ATC TTA GTT TTA ACT GCC GTC CCA TCC CTA CAT ATT CCG   TAC GTA AGA GAT AAG GTT AAC AAC CCT TCT CTT ACT GTC AAT GCC ATT GGT CAC            CAA CGA TAG TGA AGC TAA GAA TAC ACA GAG TAT TAA GAG TCA GAC TTC GAT TCT TAC ATA GTC CCA ACA GCA GAC TTA AAG CCA GGA GAA CTT CAG CTC CTC AAA GCT GAT AAC CGA ACG ATT CTC CCA ATA GAG ATC CCA CCC AT. ATA TGA ATC TTA TTA GAG GAT GTC CTG CAC TCA TGT CCT ..C CCC TCA CTG GGC CTC AAG ACA GAT GCA ATC CCT GGA CAC TTA          AAT CAA ACT        ACC TTG ACT GCT GCA      TGC CCA GAC CTT TAC TAT GGA CCG TGC TCA GAA ATG TAT GGG TTT AAC CAC AGT TTT ATA ACT ACT GTC CTA AAA TTA ATC CCC TTA AAA TGC TCC AAA GCC TGG TGC ACA T   CCACACTCTAATAT  

Orangutan   4   ATG aCT CAt GCA GTT CAg TtA GGa CTT CAA GAC gCT ACA TCC tCT ATT ATA GAA GAA CTA CTC ACT TTc CAT GAc CAC ACT CcT cTA AaT ATT TTC CTA AaT AGt TCC CTA GTC CTA TAC ATT ATT TCC CTA ATA CTC ACA ACA AAA TTA AcT CAT ACT AGC ACC AtA GAT GCC CgA GAA ATC gAa AtT gTG TGA ACT ATT TTA CCT GCC      ATT ATC TTA ATT TTA ATT GCC CTC CCA TCC CTA TGT ATT CTG   TAA ATA ACa gat gaa atT AAC AAC tCT aCT CTT ACC aTC AAA gCA ATT GGC CAC            CAA TAA TAT TGA AaC TAT GAA TGT ACA GAC T.. GAA GAA TTA gGC TTC GAT TCT TAT ATA ATT CCA ACA GCA GAC TTA AAG CCA GGA GAA CTT CAA CTt CTC aAA GTT GAT AAC CAA ACA ATT CTC CCA AtA GAT ATC CCC ATC CgT aTA TTA ATC TCA TCC aAA GAc GTC CTG CgC TCA TGA ACT ATC CCC TCA TTG GGC CTG AAA ACA GaT GCA ATC CCT GGA TGC CTA          AAT CAA ACC        ACC CTA ACT GCT AcA      tGA CCA GgC CTT TAC TAT GGA CAG TGC TCA GAA ATt TGT GGG TtC AAC CAC AGT GTT ATA CCT ATT GTC CTA GAA TTA ACc CCC TgA AAA TGC TTC AAA ACC TGA TCC AtG T   tCACACTATAAtAT
Rhesus      4
                GAGATAT TG GTAT AACT.  .... . ..... TTGTCAA  AGTTA ATTT ATAGG TTAAAA  CtCTA  TGTGTCTT A
                ATG GtT CAt cCA TTT CAA TTA GGT CTT CAA GAT GCT ATA TCT CCT ATT ATA GAA GAA TTA CTT AaT TTT CAa GAC CAC ACT CTT ATA ATT GTT TTC CTA ATT AGT TCT CTG GTT cTC TAT ... ATT TCC CTC ATA cTG AaA ACA aAA TTA ACA CAC ACT AGC ACT ACA gAT GCC CAT GAA GTA GAA ACT ATA TGG Agg ATC TTA CCc GCT      ATT ATC CTA ATT TTA ATT GcC tTC CcA TCT CAA tGT ATC CTA   TAT ATG ATt AGATGgA ATT AAT AAC CCC TcT CTC ACT GTC AAA ACA ATT GGC CAT            CAG TGA TAT TGA ATT TAT GAA TAT ACA GAT TAT GAG GAC TTA GGC TTC gAg TCT TAC ATA ATC CCT ACA ACA GcC TTA AAA CCA GGA GAA CTA CGA CTC tTC AgA tTT GAC AAT CgA GTa GTT CTC CtA ATA GAA ATT CCT ATT caT GTA TcA ATc TCA TCc GAA GAc GTT CTA tAC TCA TGA GCc aTC CCA TCA CTG GGC CTC AaA ACA GAT GCa ATC CCC AGG CGC TTA          AAC CAA AcG        ACC TTG ACC ACC ACA      cGG CCA GGC CTT TAC TAa GgC cAA TGC TCA GAA ATC TGT GGA TtC aAC CAC AGC TTT gTA CCC ATT gTT CcA GAA TTA GTC CCC CTA AAA TGC TTt gAA ACC TGA TCT ATA TCC aTA CTC CAA TGT  

Gibbon     18   ATG GCt CAT CtA GTT CAg TTA GGc CTT CAA GAC GCT TCA TCC CCT AtT ATA GAA GAA CTg CTc ACt TTC CAT GAt CAC gCT CTT ATA ATT ATT TTC CTA ATT AGT Tcc ctg gtc cta tat att att tgc cca ata ctc aaA ACA AAA CTa AcT CAT ACT AGC ACc gTA GAT GcC CAA GAA ATt AAG ACT GTt TgA ACT ATC TTa CCT GCt      att atc tta gtt TTA ATT GtC CTC CCA TCc CTA aGT ATt CTa   TAt tTA ACA GAT aAA ATt AAc AAT CCT TCa CTt ACC ATT AAA ACt ATT GGc CaT            CAA TGa TAT TGA AGC TAt GAa TAT AcA GAc Tgc aAA GAA TTA gGC TTt gAT TCT TAT ATA gTc CCA ACA GCt gAC TTA AAA CCA Ggg GAt TTT tgA CTC gTC acA gTC GAT AAC CgA ACA ATt CTC cCA AcA GAg ATT CCC ATC Cat Ata TTA ATt aCA TCt gtA GAc GTC CTG CAC TCA TGa ACT ATC CCC tCA TTg cGt cTc AAA ACA GAc GCA ATC tCc GGA CAC cTA          AAt CAA TcT        GCC TTA ACt gCc ACA      CcA tCA GGC CTt TAC TAc GgA CAg TGt TCA GAA ATt TGT Gat TtT AAt CAg AGT TTT AtA cCT ATT GTc cTA GAA cTA GTt CCc TTA AAA gac TTC gAA AtT TGa TCT AcA T   CCACACTATAgtaaT
Chimp       7   ATG GCC CAT CCA GTT CAA TTA GGT CTT CAA GAt GCT TCA TCC CCT ACT ATA GAA GAA CTA CTT ACC TTC CAT GAC CAC ACT CTT ATA ATT ATT TTC CTA ATT AGT TTC cTG GTT CTA TAC ATT ATT TCT CTA AT. ... ACA ACA AAg CTG ATT CAT ACT AGC ACT ATA GAT GcC CAA GAA ATA AAG ACT GTC TgA cCT gTC TTG CCT GCC      ATC Agc tta aTC TTA ATT GCC CTC CCA TCc CTA TGT ATt CTG   TAC gTA ACA GAT GAA ATC AAT AAc CCc cCT CTC ACC ATT AAA ACA ATT GGA CaT            CAA TGG TAT TGA AGC TAC GAG TAT ATA GAT TAT GAA GAA TTA AGC TTC ggT TCT TAT ATA cTT CCA ACA GCC AAC TTA AAA CCA GAA GAA cTT CAA CTC CTC aAA TTC GAT AAC CAA gCA TCC TCT CAA TAG AAA .TT CCC ATC CGC AtG TTA ATt TCA TCC AAA GAT GTC CTG CAC TCA TGa ACT ATT CCC tCA TTA GGG TTA AAA ACA GAT GCA gTC CCT GGA CgC TTA          AAC CAA TTT        GCC TTA ACC ACT ACA      tGA CCA GGC CTC TAC TAT GgA CAA cGC TCA GAA ATG TGT GGA TCT AAC CAC AGc TTT AtA TCT ATT GTT TTA aAA TTA GTC CCA TTA AAA AcT TTC AAA ACT TGG TCT ATA T   CCACACTATAATCT
Marmoset   13   ATG GCT CAT CtA GtT CAA TTA GGC CtT CAA GAC gCt ACA TtC CCT ATT gTA GAA GAA tga CTC ACT tTC CAa GAC CAC atT CTT tTA ATT ATT TTC CTA ATt aGT TcC CTc aTC CTA TAT ATT ATC TCC CTA AcA CTC ACc ACA AAA TTA ACT CAT ACT ggC ACC AtA cAT GCC CAA aAA AcC gAG ACT caC Tga ACT ACc TTt ctT ACC      aTT ATC TTg aTT TTA AtT GCC cTC CCA cCC CTA tgT ATT CtG   cAC aTg AcA aAT gAG GTT AAC AAt gCT TCT CTT ACc aTt AAa GCa ATT GGT CAC            CAA tGA TAt TGA AGC TAc GAA TAt ACA GAc TAT gAA GAG TtA GgC TTt tAT TtT TAt ATA GTC CCA ACA GCc GAC TTA AAG CCA GGA GAA gTT CAa CTC CTt gAA GtT GAT AAC tGA Ata ATT CTa CCA ATA GAG ATt CCC AtC tgT gcA TtA ATC TcA Tct GAa GAc aTC CTG tAC TCA TGa act gTC CCC TCA CTG GGC CTC AAa ACA GAT GCA AcC CCT Gat gct gaa          acC AAA CTA        
Human       7   ata gtt cat cta ttt cag cta ggt ctc caa gat gct ACA TCC CCT ATT ATA cAA GAA CTa CTC ACT tTC CAT GAC CAC aCT CTT aTA ATT cTT TTC CTc ATt aGT TcC CTg GcC CTA TAT ATT ATt TCC CTA Atg ctg ACA ACA AAA TTA ACT CAT gCT AgC ACt AtA GAT GCt CAA GAg AaC gAG AaT aTg Tga gCT AtT TTA ccc ACC      aTT ATC cTg aTc TTA AtT GtC cTC CCc Tgt CTt CgT ATT Cta   TAC tTg AcA GAT gAa aTT AAt AgC CCg TCc CTc ACT GTC AAa aCa AcT GGc CAC            CAA tGA TAc TGA AGC TAt GAg TAt ACA GAc TAT gAA GAt gtA agt TTC GAT TCT TAC ATg act CCA ACA aCA GAC TTA AAa CCA GGA GAA CTT Cga CTC CTt gAA GCT GgT AAC CaA ACa ATT CTC CCA Aca gaa atc cct att cgt ata tta atc tca tct gaa gac GTC CTG CAC TCA caa act aTC CCg TCA CcG GGC CTC AAa ACA GAT GCA ATC CCT GGA CgC TTA          AAT CAA ACc        Att TTa ACT GCT aCA      aGa CCA GgC CTT TAC TAT GGc Caa TGC TCA GAA ATt TgT GGG Tcc AAC CAC AGT TTT AcA ctT Atc aTC CTA gAA TTA gTt CCC TTA AAA TGC Ttt gaa acc tga gca aca t   ctacactatat
Chimp       4   atg gct cat gca gtt caa tta gga ctt CAA GAT GCT ACA TCC CtT ATT ATA gAA GAA CTA CTC ACT TTC CAT GAC CAC ACT CTT AcA ATT aTT TTC CTa ATT AGT TCC CTa GtC CTA TAc ATT ATT TCC CTA ATa tTc ACA ACA AAA TTA ACT CAT aCT AGC ACc ATA GAT GCc tAA GAa AtC GAG AcT gTG TGA aCT ATT TTg Ctt gCC      ATT ATC tTa ATt TTA ATT GcC CTC CCa Tcc CTa CaT ATT CTg   TAa aTa ACA GAT GAA ATT AAc AaC CCt gCt CTt ACa GTC AAA gCA AtT GGC CAC            CAA TaA TAt TGA AaC TAT GAa TgT ACA GAC TAT GAA GAa tTA gGc TTC GAT TCT TAt ATa AtT CCA ACA gCA GAC TTA AAg CCA GGA GAA CTT CaA CTC CTc aAA GtT GaT AAC CAA ACA ATT CTC CCA AtA GAt ATC CCc ATc CGT AcA TTA ATC TCA TCT GAA GAt GTC CTG CAC TCA tgA ACT ATC CCc TCA ttG GGC CTg AAA ACg GAT GCA ATC CCT GGA tGC cTA          AAT CAA ACC        Acc cTA ACT GCT ACA      tGA CCA GGC CTT TAC TAT GGa CAg TGC TCA GAA ATT TGT GGG TCC AAC CAC AGT gTT AtA CcT ATt gTC CTA GAA TTA acc CCC TTA AAA TGC TTc GAA ACC TGA tCc Atg T   CcACACTATAAT
Human       4   ATG GCT CAT GCA GTT CAA TTA GGA CTT CAA GAc aCT ACA TtC CTT ATT ATg GAA GAA CTA CTC ACT TTC CAT GAC CAC ACT CTT AtA ATT ATT TTC CTA ATT AGT cCC CTA GTC CTA TAC ATT ATT TCC CTA ATA TTC ACA ACA AAA TTA ACT CAT ACT AGC ACC ATA GAT GCC cAA GAA ATC cAG ACT GTG TGA ACT ATT TTa CTT GCC      ATT ATC TTA ATT TTA ATT GCC CTC CCA TCC CTA CgT ATT CTG   TAA ATA ACA GAT GAA ATT AAC AAC CCT GCT CTT ACA GTC AAA GCA ATT GGC CAC cattggccac CAA TAA TAT TGA AAC TAT GAA TGT ACA GAC TAT GAA GAA TTA GGC TTC GAT TCT TAT ATA ATT CCA ACA GCA GAC TTA AAG CCA GGA GAA CTT CAA CTC CTC AgA GTT GAT AAC CAA ACt ATT CTC CCA ATA GAT ATC CCC ATC CaT AtA TTA ATC TCA TCT GAA GAc aTC CTG CAC TCA TGA ACT ATC CCC TCA TTG GGg CTG AAA ACa GAT GCA ATC CCT GGA TGC CTA          AAT CAA ACC        ACC CTA ACT GCT ACA      TGA CCA GGC CTT TAC TAT GGA CAG TGC TCA GAA ATc TGT GGG TCC AAC CAC AGT GTT ATA CCT ATT GTC CTA GgA TTA ACC CCC TTA AAA TGC TTC GAA ACC TGA TCC ATG T   CCACACTATAAT
Human       6   ATG GCT CAT CCA TTT CAA TTA GGT CTT CAA GAT GCT ATA TCT CCT ATT ATA GAA GAA TTA CTT AAT TTT CAT GAC CAC ACT CTT ATA ATT GTT TTC CTA ATC AGT TCT CCG GTT TTC TAT ATT ATT TCC CTC ATA GTG ACA ACA GAA TTA ACA CAC ACT AGT ACT ACA GAT GCC CAT GAA GTA GAA GCT ATA TGG AAT ATC TTA CCT GCC TGCT ATT ATC CTA ATT TTA ATT GTC CTC CCA TCT CAA CAT ATC CTA   TAT ATG ACA GAT GAA ATT AAT AAA CCC TTT CTC ACT GTC AAA ACA ATT GGC CAT            CAG TGA TAT TGA ATT TAT GAA TAT ACA GAT TAT GAG GAC TTA GGC TTC GAT TCT TAC ATA ATC CCT ACA ACA GAC TTA AAA CCA GGA GAA CTA CGA CTC CTC AAA GTT GAC AAT CGA GTA ATT CTC CCA ATA GAA ATT CCT AT. TGT GTA TTA ATT TCA TCA GAA GAT GTT TTA CAC TCA TGA GCT GTC CCA TCA CTG GGC CTC AAA ACA GAT GCC ATC CCC AGG CGC TTA          AAC CGA ATG        ACC TTG ATC ACC ACA      TGG CCA GGC CTT TAC TAT GAC CAA TGC TCA GAA ATC TGT GGA CCC AAC CAC AGC TTT ATA CCC ATT GTT CCA GAA ATG GTC CCC CTA AAA TGC TTT GAA ACC TGA TCT ATA T   CCATACT  
Chimp       6   ATG GCT CAT CCA TTT CAA TTA GGT CTT CAA GAT GCT gTA TCT CCT ATT ATA GAA GAA TTA CTT AAT TTT CAT GAC CAC ACT CTT ATA ATT GTT TTC CTA ATC AGT TCT CCG GTT TTC TAT ATT ATT TCC CTC ATA GTG ACA ACA GAA TTA ACA CAC ACT AGc ACT ACA GAT GCC CAT GAA GTA GAA aCT ATA TGG AAT ATC TTA CCT GCC TGCT ATT ATC CTA ATT TTA ATT GTC CTC CCA TCT CAA CAT ATC CTA   TAT ATG AtA cAT GAA ATT AAT AAc CCC TTT CTC ACT GTC AAA ACA ATT GGC CAT            CAG TGA TAc TGA ATT TAT GAA TAT ACA GAT TAT GAG GAC TTA GGC TTt GAT TCT TAC ATA ATC CCT ACA ACA GAC TTA AAA CCA GGA GAA CTA tGA CTC CTC AAA GTT GAC AAT CGA GTA tTT CTC CCA ATA GAA ATT CCT AT. TGT GTA TTA ATT TCA TCA GAA GAT GTT TTA CAC TCA TGA GCT GTC CCA TCA CTG GGC CTC AAA ACA GAT GCC ATC CCC AGG CGC TTA          AAC CGA ATG        ACC TTG AcC ACC ACA      TGG CCA GGC CTT TAC TAT GAC CAA TGC TCA GAA ATC TGT GGA CCC AAC CAC AGC TTT ATA CCC ATT GTT CCA GAA ATG GTC CCC CTA AAA TGC TTT GAA ACC TGA TCT ATA T   CCATACTccaatgt
Gorilla     6   ATG GCT CAT CCA TTT CAA TTA GGT CTT CAA GAT GCT aTA TCT CCT ATT ATA GAA GAA TTA CTT AAT TTT CAT GAC CAC ACT CTT ATA ATT GTT TTC CTA ATC AGT TCT CCG GTT TTC TAT AcT ATT TCC CTC ATA GTG ACA ACA GAA TTA ACA CAC ACT AGC ACT ACA GAT GCC CAT GAA GTA GAA ACT ATA TGG AAT ATC TTA CCT GCC TGCT ATT ATC CTA ATT TTA ATT GTC CTC CCA TCT CAA CAT ATC CTA   TAT ATG ATA gAT GAA ATT AAT AAC CCC TTT CTC ACT GTC AAA ACA ATT GGC CAT            CAG TGA TgC TGA ATT TAT GAA TAT ACA GAT TAT GAG GAC TTA GGC TTT GAT TCT TAC ATA ATC CCT ACA ACA GAC TTA AAA CCA GGA GAA CTA cGA CTC CTC AAA GTT GAC AAT CGA GTA aTT CTC CCA ATA GAA ATT CCT AT. TGT GTA TTA ATT TCA TCA GAA GAT GTT TTA CAC TCA TGA GCT GTC CCA TCA CTG GGC CTC AAA ACA GAT GCC ATC CCC AGG CGC TTA          AAC CGA ATG        ACC TTG ACC ACC ACA      TGG CCA GGC CTT TAC TAT GAC CAA TGC TCA GAA ATC TGT GGA CCC AAC CAC AGC TTT ATA CCC ATT GTT CCA GAA ATG GTC CCC CTA AcA TGC TTT GAA ACC TGA TCT ATA T   CCATACTCCAATGT
Orangutan   6   ATG GCT CAT CCA TTT CAA TgA GGT CTT CAA GAT GCT ATA TCT CCT AcT ATA GAA GAA TTA CTT AAT TTT aAT GAC CAC ACT CTT ATA ATT GTT TTa CTA ATt AGT TCT CtG GTT TTC TAT AtT ATT TCC CTC ATA GTG ACA ACA GAA TTA ACA CAC ACc AGC ACT ACA GAT GCC CAT GAA GTA GAA ACT ATA TGG AAT ATC TTA CCT GCC TGCT ATT AcC CTA ATT TTA ATT GTC CTC CCA TCT CAg CAT ATC CTA   TAT ATG ATA GAT GAA ATT AAT AAC CgC TTT CTC ACT GTC AAA ACA ATT GGC CAT            CAG TGA Tat TGA ATT TAT GAA TAT ACA GAT TAT GAG GAC TTA GGC TTc GAT TCT TAC ATA ATC CCT ACA ACA GAC TTA AAA CCA GGA GAA CTA CaA CTC CTC AAA GTT GAC AAT CGA GTA gTT CTC CCA gTA GAA ATT gCT AT. TGT GTA TTA ATT TCA TCA GAA GAT aTT cTA CAC TCA TGA GCT GTC CCA TCA CTG GGC CTC AAA ACA GAT GCC ATC CCC AGG CGC TTA          AAC CaA ATG        AtC TTG ACC ACC ACA      TGG CCA GGC CTT TAC TAT GAC CAA TGC TCA GAA ATC TGT GGA CCC AAC CAC AGC TTT ATA CCC ATT GTT CtA GAA tTa GTC tCC CTA AaA TGC TTT GAA ACC TGA TCT AcA T   CCATACTCCAATGT
Gibbon      3   ATG GCT CAc gCA TTT CAA TTA GGT CTT CAA GAT GCT ATA TCT CCT ATT ATA GAA GAA TTA CTT AgT TTT CAT GAC CAC ACT CTT ATA ATT GTT TTC CTA ATt AGT TCT CtG GTT TTC TAT AtT ATT TCC CTC ATA .TG ACA ACA GAA TTA ACA CAC ACT AGC ACT ACA aAT GCC CAT GAA GTA GAA ACT ATA TGG AAT ATC TTA CCT GCC TGCT ATT ATC CTA ATT TTA ATT GTC CTC CaA TCT CAA CgT ATC CTA   TAT ATG ATA GAT GAA ATT AAT AAC CCC TTT CTC ACT GTC AAA ACA ATT GGC CAT            CAG TGA Tat TGA ATT TAT GAA TAT ACA GAT TAT GAG GAC TTA GGC TTc aAT TCT TAC ATA ATC CCT ACA ACA GAC TTA AAA CCA GGA GAA CTA CGA CTC CTC AAA GTT GAC AAT CaA GTc gTT CTC CCA ATA GAA ATT CCT AT. TGT GTA TTA ATT TCA TCA GAA GAT GTT cTA CAC TCA TGA GCT GTC CCA TCA CTG GGC CTC AgA ACA GAT GCt ATC CCC AGG CGC TTA          AAC CaA ATG        ACC TTG ACC ACC ACA      TGG CCA GGC CTT TAC TAT GAC tAA TGC TCA GAA ATC TGT GGA tCC gAC CAC AGC TTT ATA CCC ATT cTT CtA GAA tTa GTC CCC CTA AaA TGC TTc aAA ACC TGA TCT ATA T   CCtTACTCCAATGT
Human       3   ATG GCT CAT CCA TTT CAA GTA GGC CTT TGA GAC GCT ACA TCC CCT ATT ATA GAA GAA CTG CTC ACT TTC CAT GAC CAC ACT CTT ATA TTT TCT TAA TTA GTT CTT AAT TAA TTA GTT CTT AAT TAG TTC CCT GGT CCT CTC TAT TTA TCT CCC TAATACTCAGAACAAAATTAACT CATACTAGCACCATAGATGCCCGAGAAACCGAGGATGTCTGAACTGTCTTACCTGCC 

Human       9   aagatat ta gcaaattca ttac g taact ttgtcaa agtta agtt atagg ctaaa  tccta tatgtctt a 
                ATG GCT CAT CCA GTT CAA TTA GGC CTT CAA GAC GCT ACA TCC CCT ATC ATA GAA GAA CCG CTC ACT TTC CGT GAC CAC GTT CTT ATA ATT ATT TTC CTA ATT AGT TCC TG. GTT CTA TAC ATT ATT TCC GTA ATA CTC ACA ACA AAA TTA ACT CAT ATT AGC ACC ACA GAT GCC CAA GAA ATT GAG ACT GTT TGA ACT ATC TTA CCT GCC      ATT ATC TTA ATT TTA A.. GGC CTC TCA TCC CTA CGT ATT CTG   TAT AAA ACA GAT GAA GTT AAT AAT CCT TCC CTT ACT GTC AAA GCA ATT GGT CAT            CAA TGA TAT TGA AGC TAT GAA TAT ATA GAC TAT GAA GAA TTA AGC 

Mouse lemur     scaffold_11645:2041-2737
                atg gcc cac cca gcc caa tta gga ttc caa gac gcc gct tcc cca atc atg gaa gaa ctt ata tat ttt cac gac cat acc ctt ata att gta ttt tta att agc tca tta gtc ctt TAT ATT ATT TCC CTt atg ctt acc acg gaa ctc act cat aca agc acc ata gac GCC CAa GAA GTA GAA ACa gta tga aca att cta cca gcg      gtt att tta att ctt att gcc ctt cca tca ctA CGT ATt tTA   TAT ATa ATA GAT GAA ATT Aca Act CCC acT CTg ACc cTt AAA ACt ATa GGt CAT            CAa TGA TAT TGA Agc TAc GAA TAT ACA GAT TAT GAa aAC cTA tGC TTt gAc TCa TAC ATA AcC CCT cCt ttA GAa cTc gAt CCA GGA GAA CTA CGA CTa CTa gAA GTT GAC AAT Cga gta gta cta cca aca gaa ata tcc att cgc ata ctc atc tct TCA GAA GAc GTa tTA CAt TCA TGA aCT GTa CCA TCt tTa GGt gTa AaA ACA GAT GCT ATC CCa gGG CGC cTA          AAt CAA gca        ACC cTa Atg ACt tCA      cGc CCA GGt aTc TAC TAT Ggt cAA TGC TCA GAA ATC TGT GGt gCa aAt CAC AGC TTT ATA CCa att gtg cta gaa cta gtt ccg cta aag cac ttt gaa gag tga cta cta t   ctacactgtaatat 

Squirrel monkey JH378267:62097-62792
                atg gca aca cca gct caa cta ggc cta caa aat gct gca tcc ccc att ata GAA GAA CTT ATc gcc TTT CAC GAt CAc gCC CTc ATA ATT ATT TTc cTA ATT AGC TCA cTA GTC TTA TAT att atg tct cta ATG CTT ACC ACa aAA tTa ACc CAT ACt AGt ACC ATA aAt GCt CAA GAA aTc GAA AtA aTc TGA ACt ATc tTA CCc GCa      aTc ATT cTt ATc aTa ATT GCC CTc CCA TCc tTA CGT ATc TTA   TAc ATA Act GAc GAA tTT Atc Aag CCC taT CTa ACC CTa AAA gCa ATt GGc CAc            CAA TGA TAT TGA AGC TAt GAA TAT tCA GAT TAc GtA gAC CTA gcC TTc GAC TCt TAC ATc ACa CCa aCa Tat ttt CTa GAa CCA GGc GAA tTt CGA CTt CTt GAA GTa GAt AAc CGA acA act CTc CCA AtA GAA gcA gat ATc CGt ATA tTa gTC TCa Ttg cAt GAt GTc TTA CAc TCA TGA gCT GTc CCc TCa cTA GGc GTt AAA ACA GAT GCa ATC CCA GGG CGC tTA          AAc CAA att        Ata CTA gcc tCc atA      CGa CCA GGa tTa Ttt TAT GGg CAA TGC TCA GAA ATt tgc ggg tca aac cat agc ttt ata ccc atc gtc cta gaa ttt att tat ttc caa gat ttc gaa gta tga gct tca t   acttatacattgtat



...................
    
CRS             CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A

...................
Pan troglodytes cactgta aa gcta acc tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag gaccgacac ctctt tacagtg a

NW_001229479.1 Pan troglodytes NUMT chromosome  1    19839-19908
                CACTGTA AA GCTA ACC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG GACCAACAC CTCTT TACAGTG A
NW_001229480.1|Ptr1_WGA1712_2:5311-5370 Pan troglodytes chromosome 1 
                            CTA ACC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG GACTAACAC CTCTT TACAGTG A
NW_001232828.1|Ptr3_WGA3385_2:c2791296-2791228
                AACTGTA AA GCTA .CC AAGC A TTAAC CTTTTAA GTTGA AGACT GAGGT GATCTATAC CTCTC TGCAGTG A
NW_001232075.1|Ptr2B_WGA2632_2:5986074-5986142 Pan troglodytes chromosome 2B
                CCCTGCT AG GCCC  TG AATA A TTAGC CTTTGAA GTTGA AGACT GAAGC GATGTATAC GTCTC TGCAGTG A
NW_001232828.1|Ptr3_WGA3385_2:c2791296-2791228 Pan troglodytes chromosome 3
                AACTGTA AA GCTA  CC AAGC A TTAAC CTTTTAA GTTGA AGACT GAGGT GATCTATAC CTCTC TGCAGTG A
NW_001234090.1 Pan troglodytes NUMT chromosome  4 1346097-1346029
                CACTGTA AA GCTA TC. TAGC A TTAAA CTTTTAA GTTAA AGACT GAGCG GATCTACAC CTCTC TGCAGTG A 
NW_001235417.1 Pan troglodytes NUMT  chromosome 5  5771624-5771693
                CACTGTA AA GCTA ACC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAG AATCACTAC CTCTT TACAGTG A
NW_001238034.1|Ptr7_WGA8591_2:c950435-950383 Pan troglodytes chromosome 7
                CACTGTA AA GCTA ATC TAGC A CCAGC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGGA GATCT
NW_001240344.1|Ptr8_WGA9911_2 64583-64652 Pan troglodytes chromosome 8
                CACTGTA AA GCTA ACC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
NW_001240439.1|Ptr9_WGA10996_2:4420380-4420448   Pan troglodytes chromosome 9
                CACTGTA AA GCTA TT. CAGC A TTTAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGGG AGTCTACAC CTCTC TGCAGTG A
NW_001220741.1|Ptr10_WGA12305_2:c12750943-12750874 Pan troglodytes chromosome 10
                CACTGTA AA GCTA ACC CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT AAGAG AATCATTAT CTCTT TACAGTG A
NW_001222311.1|Ptr11_WGA13875_2:c6933922-6933855 Pan troglodytes chromosome 11
                CACTGTA AA GCTA CT. TAGC T TTAAC CTTTTAA GTTAA GGACA GAGGG GTCTACAC  CTCTC TGCAGTG A
NW_001227452.1 Pan troglodytes NUMT chromosome 17   369880-369949
                CACTGTA GA GCTG ACC CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT AAGAG AATCGCTAT CTCTT TACAGTG A

...................

Macaca Mulatta  cactgta ta gcta tct tagc a ttaac cttttaa gttaa agacg gggga caca      ccccc tacagtg a

NW_001112552.1 Macaca NUMT Chromosome  2
                CACTGTA CA GCTA TCC TAGC A TTAAC GGGGTAA GTTAA AGACT GGGGG ACACA     CCCTC TGCAGTG A
NW_001114168.1 Macaca NUMT Chromosome  3  3474706-3474643
                CACTGTA TA GCTA TCC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACG GGGG- CACA      CCCCC TACAGTG A
NW_001118162.1 Macaca NUMT chromosome  5  6371225-6371157
                CACTGTA AA GCTA TC. TAGC A TTAAT CTTTTAA GTTAA AGACT GAGGG GATCTACAC TTCTC TGCAGTG A
NW_001122891.1 Macaca NUMT chromosome  8   767498-767561
                CACTGTA TA GCTA TCC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATG GGGG- CACA      CCCCC TGCAGTG A
NW_001122911.1 Macaca NUMT chromosome  8  7374251-7374202
                CACTGTA CA GCTG CCC CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACC AAGAG AA 
NW_001122895.1 Macaca NUMT Chromosome  8  3001101-30011037
                CACTGTA CA GCTA TCC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACG GGGGA CACA      CCCCC TGCAGTG A  
NW_001098161.1 Macaca NUMT chromosome 12 12194300-12194368
                CACTGTG AA GCTA TC. TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAT AGACT GAGGG GATCCACAC CTCTC TGCAGTG A
NW_001099020.1|Mmu13_WGA19583_1:548705-548791 Macaca mulatta chromosome 13
                TCCCTGC TG GCCC TG  AATA A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAAGG GATCTAT   ACCTC TGCAGTG A
NW_001100388.1 Macaca NUMT chromosome 14  6163952-6163884
                CACTGTC AA GCTA .CT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAA GACCTACAC CTCTC TGTAGTG A  
NW_001101664.1 Macaca NUMT chromosome 15   396591-396523
                CACTGTA AA GCTA TT. CAAT A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGGG GGTCTACAC CTTTC TGCAGTG A
NW_001218128.1 Macaca NUMT chromosome  X     4569-4520
                CACTGTA CA GCTG CCC CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAG AA
NW_001218158.1 Macaca NUMT Chromosome  X   533304-533236
                CACTGTA AA GCTA CC. CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGGG AGTCTTCAC CTCTC TACAGTG A

M. Macaca
COX2            atg gcc cac cca gtt caa cta agc cta caa gac gcc aca tcc cct gtt ata gag gaa tta att act ttc cat gac cat gct ttt ata gcc ata tct cta atc agc ttc ctg gta tta tat gcc ctg ctc tca aca ctc aca aca aaa cta acc aat act agc atc aca gat gcc caa gaa ata gaa act atc tga act atc tta ccc gca att atc tta atc cta att gct ctc cca tct cta cgt atc cta tac cta aca gat gaa gtc aat gac cca tcc ttc acc atc aaa tca atc gga cac cag tga tat tga acc tac gaa tac acg gac tac ggg agc cta att ttc aac tcc tac ata cta cct cca tta ttc cta aac cca ggg gac ctc cga ctc cta gaa gtt gac aat cgg gta gtc ctt cca att gaa gct cct gta cgt ata ata att aca tct caa gac gtc cta cac tca tga act atc ccc aca cta ggc cta aaa aca gac gcc gta cct ggg cgt cta aat caa acc gtt ttc acg gct aca       cga cca ggc gtc tat tac gga caa tgc tca gaa atc tgt ggc gca aat cat agc ttc ata cca att gtt gca gag cta atc cca cta aaa atc ttt gaa ata gga cct gta t   ttactctgtaaacaaccctgcccactctcttttttcccccaacacccctctcccaccccataaaccctcaaaacactctacaaact
Chromosome  3   ATG GCC CGC CCA GTT CAA CTA AGC CTG CAA GAC GCT ACA TCT CCT ATT ATA GAG GAA TTA ATT ACC TTC CAT GAC TAT GCT TTT ATA GCC ATA TCT CTA ATC AGC TTC CTA GTG TTA TAT GCC CTG CTC TCA ACA CTC ACA ACA AAA CTA ACC AAT ACT AAC ATC ACA GAC GCC CAA GAA ATA GAG ACT ATC TGA ACT ATC TTA CCC GCA ATT ATC TTA ATC CTA ATT GCT CTC CCA TCC CTA CGC ATC CTA TAC CTG ACA GAT GAA GTC AAC GAC CCA TCC TTC ACC ATC AAA TCA ATT GGG CAC CAG TGA TAC TGA ACC TAC GAA TAC ACG GAC TAC GGA GGC CTA ATT TTC AAT TCC TAC ATA CTG CCC CCG CTA TTC CTA AAT CCA GGA GAC CTC CGA CTC CTA GAA GTT GAC AAT CGA GTG GTC CTT CCA ATT GAA GCC CCA GTA CGT ATA ATA ATT ACA TCT CAA GAC GTC TTG CAT TCA TGA ACT ATC CCC ACA CTA GGC CTA AAG ACA GAC GCC GTA CCC GGA CGT CTA AAT CAA ACC GTT TTC ACG GCC ACA       CGA CCA GGC GTT TAT TAC GGA CAA TGT TCT GAG ATC TGT GGC GCA AAT CAT AGC TTC ATA CCA ATT GTT GCA GAA CTA ATC CCA CTA AAA ATC TTT GAA ATA GGA CCT GTA T   TTACCCTGTAAATAACCCTGTTTACCCTCTTCCCTCCTAACA---CCCCT-----ACCTCATAAACTCTCAAAATACTCTACAAACT
Chromosome  8   ATG GCC CAC CCA GTT CAA CTA AGC CTg CAA GAC GCC ACA TCt CCT GTT ATA GAG GAA TTA ATT ACT TTC CAT GAC CAT GCT TTT ATA GCC ATA TCT CTt ATC AGC TTC CTa GTg TTA TAT GCC CTa CTC TCA ACA CTC ACA ACA AAA CTA ACC AAT ACT AaC ATC ACA GAc GCC CAA GAA ATA GAA ACT ATC TGA ACT ATC TTA CCC GCA ATT ATC TTA ATC CTA ATT GCT CTC CCA TCT CTA CGc ATC CTA TAC CTA ACA GAT GAA GTC AAc GAC CCA TCC TTC ACC ATC AAA TCA ATC GGA CAt CAa TGA TAc TGA ACC TAC GAA TAC ACG GAC TAC GGa gGC CTA ATT TTC AAC TCC TAC ATA CTA CCc CCg cTA TTC CTA AAC CCA GGa GAC CTC CGA CTC CTA GAA GTT GAC AAT CGa GTA GTC CTT CCA ATT GAA GCT CCT GTA CGT ATA ATA ATT ACA TCT CAA GAC GTg ... CAC TCA cGA ACT ATt CCC ACA CTA GGC CTA AAg ACA GAt GCg GTA CCT GGa CGc CTA AAT CAA ACt GTT TTC Atg gcc aca cAC A CGA CCA GGC GTC TAT TAC GGA CAA TGC TCA GAg ATC TGT GGt GCA AAT CAT AGC TTC ATA CCA ATT GTT GCA GAa CTg ATC CCA CTA AAA ATC TTT GAA ATA GGA CCT GTA T   TTACcCTGTAAAtAACCCTGtttcccttctttcctcctagcactccccctctcccaccccgtaaactctcaaaacaccctacaaact
Chromosome 12                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCA GGC CTT TAC TAT GGA CAG TGC TCA GAA ATC TGT GGG TCT AAC CAC AGT TTT ATA CTT GTT GTC CTA GCA TTA ACG CCC TTA AAA TGC TTT GAA Acc tga tct aca t   ctgcactgtaatat                               
...................

Marmoset

chromosome  8   
                CACTATA AA GCTA CT  CAGC A TTAAC ATTTTAA GTTAA AGACT TA.GG TATCTACAC CTCTC TGCAGTG A  before:taaccccctt aaaatactt   caaaacctgat ccacatt   cacac tataatat
Chromosome  9   
                CACTGTA AA GCTA aaC CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGAtT GAGag aacccct   CTCTC TACAGTG A  before:                       caagattttg aagtatgagc   ctcatactta  tatattgtat
Chromosome 13   
                caccatg AA GCTA cC  cAGC A TTAAc CTTcaAt GTTAA AGACT GAGGG tATCcACgC cTCTC TGCAGTG A  before: gtgctagaat taatcccctt caaatacttc taaacctgat cgcac tataatat
Chromosome 15   NC_013910  26684510-26684576
                CACTGTA AA GCTA ACt TAGC A TTAAC CTTgTAA GTTAA AGATT GAGAG AAcctC    CTCTc TACAGTG A


Marmoset COX2   atg gca gca cca gcc caa tta ggc cta caa aac gcc gca tcc cca atc ata gaa gaa ctt att gcc ttc cat gac cat gct cta ata att atc ttc tta att agc tca cta gtt cta tac atc atc tct cta ata ctt act aca aaa ctg aca cac acc agt acc atg aac gct caa gaa atc gaa atg atc tga act atc cta cct gca ata atc ctc att ata att gcc ctt cca tcc cta cgc att tta tat ata aca gac gag ttt aat aaa cca tat cta acc ctt aaa gca atc ggc cac caa tga tac tga agt tac gaa tac tcc gac tat gaa gac tta gca ttc gac tcc tac att ata cca aca tac ttc ctt gaa ccc ggg gaa ttc cga ctc ctt gaa gta gac aac cga aca acc ttg cct atg gaa gca gat atc cgt gta tta atc tca tca caa gac gtt tta cac tca tga gct gta cct tca cta ggc gtg aaa acc gat gca atc ccc gga cgc tta aat caa gcc ata gta gct tcc ata cga cca ggc cta tac tac gga caa tgc tca gaa att tgc ggg tct aac cac agc ttt atg ccc att gta cta gaa ttt atc tat ttc caa gat ttc gaa gta tga gcc tca tac tta tac att gta t
Chromosome  1   gtg gct cac CCA GCC CAA CTA GGT CTA CAA AAC GCT ACG TCC CCC ATT ATA GAA GAA CTA ATT GAT TTC CAT GAT CAC ATC CTC ATA ATT ATT TTC CTA ATT CGC TCT CCA GTC CTA TAT GTT ATT TCC CTA ATA CTT ACT ACA AAG CTA ACC CAT ACC agc acc ata aac gct caa gaa atg gaa ata atc tga act atc cta ccc gcc att att ctt att aag ttg ccc tcc cat ccc tac gga atc ctg tac ata aca gac ggg ttt aat aaa ccc tac tta acc ctt aaa gca act ggt ctc caa tga tac tga agc tac gaa tac tca gac tat gaa gac tta gct ttt
Chromosome 15   ATG GCA aCA CCA GCt CAA TTA GGC tTA CAA AAC acc aca tTC CCC AtT ATA GAA GAA CTT ATc GCC TTC CAc GAC CAT GCT tTt ATA ATc ATt TTC TTA ATT AGC TCA CTA GTT CTA TAt ATC ATt TCT CTA ATA CTT ACT ACA AAA CTc ACc CAC ACC AGT ACC ATG AAg GCT CAA GAA ATC GAA ATa ATC TGA ACc atc ttg cct gcc ata att ctc ... ATA ATT tCC CTc CCA TCC CTA CGt ATT TTA TAT gTA ACA GAC GAa TTT AAT AAA CCc TAc tTA ACC CTT tAA GCA ATt GGt CAC CAA TGA TAC TGA AGc TAt GAA TAC TCt GAC TAT GAA GAC TTA GCA TTt GAC TCt TAt ATT ATg CCA ACA TAt TTC CTT GAg CCC GGa GAA TTt tGA CTC CTT GAA GTA GAC AAC C.a aaa act ttg ccc ata GAA GCA GAT ATt CGT aTg cTA ATt TCA TCA CAA GAC GTc cTA CAC TCA TGA GCT GTA CCa TCA CTA GGt GTa AAA ACa GAT GCA ATC CCC GGA CGt TTg AAT CAA GCC ATA cTA tCc TCC ATA CGA CCA GGt CTA Ttt TAt GGA CAA TGC TCA GAA ATT TGC GGa TCT AAt CAC AGC TTT ATt CCC ATT GTc CTA GAA TTc ATt TtT TTC CAA GAT TTt GAA GTAtTGA GCC TCA TAC TTt TAC ATT GTA T
Chromosome  6   ATG GCA GCA CCA GCT CAA TTA GGC TTA CAA AAT GCC GCA TCC CCC ATC ATA GAA GAA CTT ATC GCC TTC CAT GAC CAT GCT CTC ATA ATC ACT TTT TTA TTT AGC TCA CTG GTT CTA TAC ATT ATT TCT CTA ATA CTT ACT ACA AAA CTA ACT CAC ACC AGT ACC ATA AAT GCT CAA GAG ATT GAA ATA ATC TGA ACC ATC CTG CCC GCT ATA ATT CTC ATT ATA ATT GCC CTT CCA TCC CTA TGT ATT TTA TAT ATG ACA GAC GAA TTT AAT AAA CCC TAC CTA ACT CTT AAA GCA ATT GGC CAC CAA TGA TAC TGA AGT TAT GAG TAT TCC GAT TAT GAA GAC TTA GCA TTC GAC TCT TAT ATT ACA CCA ACA TAT TTC CTT GAA CCT GGA GAA TTT CGA CTC CTT GAA GTA GAC AAC GGA ACA ACC TTA CCC ATA GAA GCA GAT ATT CGT GTG CTA ATT TCA TCA CAG GAC ATC CTA CA. TCA TGA GCT GTG CCA TCA CTA GGT GTA AAA ACA GAT GCA ATC CCT GGA CGC TTA AAT CAA GCC ATA TTA ACT TCC ACA CGA CCA GAC ATA GTC TAT GGA CAG TGT TCA GAA ATT TGT GGG TCC AAC CAC AGC TTT ATG CCC ATT GTA CTA GAA TTT ATT TAT TTC CAA GAT TTC AAA GTA TGA GCC TCA TAC TTA TAT ATC GTA T

...................

Squirrel Monkey
JH378267:62097-62784
                ATG GCA ACA CCA GCT CAA cTA GGC cTA CAA AAt gCt gCA TcC CCC ATT ATA GAA GAA CTT ATC GCC TTt CAC GAt CAc GCc cTc ATA ATt ATT TTC cTA ATT AGC TCA CTA GTc tTA TAT ATt ATg TCT CTA ATg CTT ACc ACA AAA tTa ACC CAt ACt AGT ACC ATa AAt GCT CAA GAA ATC GAA ATA ATC TGA ACt ATC TTa ccc gca atc att ctt atc ata att gcc ctc cca tcc tta cgt atc tta tac aTA ACt GAC GAA TTT Atc AAg CCC TAt cTA ACC CTa aAA GCA ATT GGc CAC CAA TGA TAt TGA AGC TAT GAA TAt TCa GAt TAc GtA GAC cTA GCc TTc GAC TCT TAc ATc Aca CCA ACA TAT TTt cta gaa cca ggc GAA TTT cGA CTt CTT GAA GTA GAt AAC Cga aca act ctc cca ATA GAA GCA GAT ATc CGT ATa tTA gTc TCA Ttg CAt GAt GTC tTA CAC TCA TGA GCT GTc CCc TCA CTA GGc GTt AAA ACA GAT GCA ATC CCa GGg CGc TTa AAc CAA att ATA CTA gCC TCC ATA CGA CCA GGa tTA TTT TAT GGg CAA TGC TCA GAA ATT TGC GGg TCa AAc CAt AGC TTT ATa CCC ATc GTC CTA GAA TTt ATT TaT TTC CAA GAT TTc GAA GTA TGA GCt TCA TAC TTa TAC ATT GTA T
...................

Bos taurus      CACTAAG AA GCTA TA. TAGC A CTAAC CTTTTAA GTTAG AGATT GAGAG CCATATA   CTCTC CTTGGTG A

NW_001493748.1|Bt1_WGA132_3:648030-648097     Bos taurus chromosome  1
                ATTCATT AA GCTA AGC TAGC A CTAGC CTTTTAA GTTGG AGATT GGAAG TTAAATT   CCCTT TAATGAT A
NW_001493852.1|Bt1_WGA45_3:c43498-43433       Bos taurus chromosome  1
                CATTAAG AA GCTG AAT .AGT A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAG TTAAAA    TCTCC CCTTAGT G
NW_001494560.1|Bt2_WGA208_3:769776-769843     Bos taurus chromosome  2
                CATCAAG AA GCTA TAT CAGC A CTAAC CTTTTAA GTTAG AGATT GAGAG CATAATA   CTCTC CTTGGTG G
NW_001494819.1|Bt3_WGA467_3:269877-269943     Bos taurus chromosome  3
                CACCAAG AA GCTA TA. CAGC A CTAAC CTTTTAA GTTAG AGATT GAGAG CATCATA   CTCTC CTTGGTG A
NW_001493134.1|Bt13_WGA1642_3:112535-112572 Bos taurus chromosome 13
                CGTAAGA AA GCTA AAT TAGC A CTAAC CTTTTAA GTTAG 
NW_001493926.1|Bt20_WGA2234_3:c391538-391472  Bos taurus chromosome 20
                CATTAAG AA GCTA A.A TAGT A TAAAC TTTTTAA GTTAA AAACT GAGAA TTTCAAC   ATTTC CCTAAGG A
NW_001494260.1|Bt24_WGA2568_3:1880802-1880869 Bos taurus chromosome 24
                CATTAAA AA GATA AAT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AAATT GAGAG TCAAAAC   TCTCC TTAAAGT C
NW_001508704.1|BtX_WGA2892_3:100092-100159    Bos taurus chromosome  X
                CATTAAG AA GCTA AAA TAGC A TTAAC CTTTTAG GTTAA AAACT GAGAG TCTTGAC   CTTGG ATCAATG A

...................

Human Mutations found in published genealogical sequences:-
CRS             CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A

C8295T

A8296G
AP008839(Japan) cgctgta aa gcta act tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag aaccaacac ctctt tacagtg a 
C8297-
EF657285(Eur.)  CA.TGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
T8298C
AY195775(Eur.)  caccgta aa gcta act tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag aaccaacac ctctt tacagtg a 
A8301G
EU092905(Africa)CACTGTG AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
A8308G
AY714040(India) cactgta aa gcta gct tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag aaccaacac ctctt tacagtg a
T8310C
DQ304955(Afr_A) CACTGTA AA GCTA ACC TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
T8311C
DQ341066(Ethi.) CACTGTA AA GCTA ACT CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
G8313A
DQ779928(Geor.) CACTGTA AA GCTA ACT TAAC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
T8323C
HQ012176(Mex.)  CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTCTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
T8329G
DQ112735(Burk.) cactgta aa gcta act tagc a ttaac cttttaa ggtaa agatt aagag aaccaacac ctctt tacagtg a
G8334A
EF657608(Asia)  CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AAATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
T8337C
FJ383398(India) CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATC AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
A8343G
EF657786(Eur.)  CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG GACCAACAC CTCTT TACAGTG A
A8344G
AY195750(Eur.)  cactgta aa gcta act tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag agccaacac ctctt tacagtg a
C8346-
EF184596(Tanz.) CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AAC.AACAC CTCTT TACAGTG A
A8347G
AY495328(Eur.)  cactgta aa gcta act tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag aaccgacac ctctt tacagtg a 
A8348G
AY738975(Eur.)  cactgta aa gcta act tagc a ttaac cttttaa gttaa agatt aagag aaccagcac ctctt tacagtg a

Neandertal
AM948965
A8348G          CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAGCAC CTCTT TACAGTG A


The mutations are present in these haplogroups (no mutations are common):

C8295T  - 1 - 
A8296G  -  D11 M29
C8297-  -  T2
T8298C  -  H1
T8300C  -  U7a4a1a2
A8301G  -  L2a
A8308G  -  H1 M7 N1c U2e
T8310C  -  J1c L2a
T8311C  -  L3  (L3x?)
G8313A  -  M1a
T8323C  -  B2
T8329G  -  L1 L2c
G8334A  -  A
A8343G  -  B G2 H H5
A8344G  -  H7 V
C8346-  -  L0f
C8346A
C8346T
A8347G  -  A2 L3 V
A8348G  -  H1 L1
A8360G  -  M23




2011 & 2017